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hunter_chen

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助polyrate安装运行问题

最近想用polyrate进行反应速率常数的计算,但是安装运行一直出现问题,还请大神能够指导指导,感激不尽!!!
下面是问题的具体描述:我的系统是64位桌面版的Ubuntu12.04(以前没用过linux,比较小白),软件版本为polyrate2010-A,安装过程如下

chenchaoxu@Hunter:~$ cd polyrate2010-A
chenchaoxu@Hunter:~/polyrate2010-A$ ./configure

Welcome to POLYRATE 2010-A!


Do you want POLYRATE 2010-A to be your
new default version of POLYRATE?   [ yes ]: yes

                            Notice to users
************************************************************************
Starting from version 2008, POLYRATE has two kinds of executables:

1. RP-VTST for reactions with potential energy barriers (serial code)
2. VRC-VTST for barrierless bimolecular association reactions (MPI code)

RP-VTST and VRC-VTST need different executables and they should be
compiled separately by running this script
************************************************************************

Cleaning the src/ directory ...

... processor is x86_64
... OS is Linux

Is this running used to generate Makefile for RP-VTST or VRC-VTST?
[ Choose 'RP' or 'VRC' ]: RP
....found Intel Fortran compiler - ifort :/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.1.106/bin/intel64/ifort
....found MPI compiler :/usr/bin/mpif77
....found Intel C compiler :/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.3.174/bin/intel64/icc
....found MPI C compiler :/usr/bin/mpicc

Do the options chosen above look OK? [ yes ]: yes
... installing
.... creating Makefile

---- POLYRATE INSTALLATION COMPLETE ----

Have a nice day!

.... done with Makefile
到此提示安装成功了,但是在运行自带的算例的时候却出现如下提示:
chenchaoxu@Hunter:~/polyrate2010-A$ cd testrun/ch5
chenchaoxu@Hunter:~/polyrate2010-A/testrun/ch5$ ./ch5j1tr1.jc
gmake: Command not found.
mv: 无法获取"poly.fu1" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
mv: 无法获取"poly.fu6" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
mv: 无法获取"poly.fu14" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
mv: 无法获取"poly.fu15" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
mv: 无法获取"esp.fu61" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
只会生成一个time文件,内容是:
/home/chenchaoxu/polyrate2010-A/exe/polyrate2010-A.ch5.serial.exe: Command not found.
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安妮的熊爸爸

新虫 (初入文坛)

遇到了和楼主一模一样的问题,请问楼主解决了吗
2楼2017-03-31 09:58:59
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