| 查看: 532 | 回复: 0 | |||
fanghongmei金虫 (初入文坛)
|
[求助]
mmpbsa.pl计算结合自由能时出错
|
|
各位前辈： 本人最近在学习amber官网上关于用mmpbsa计算结合自由能的一个例子（http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial3/）。 当我做到这一步时：$AMBERHOME/bin/mm_pbsa.pl extract_coords.mmpbsa > extract_coords.log，出现了下面的出错信息： Use of uninitialized value in concatenation (.) or string at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 22. Can't locate mm_pbsa_global.pm in @INC (@INC contains: /src/mm_pbsa /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/site_perl /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/5.8.8 .) at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 23. BEGIN failed--compilation aborted at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 23. 这是为什么呢？实在是想不明白，求高手指点，先谢谢大家啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
药学硕士，第一、第二作者已发表6 篇 SCI，药理方向及相关方向2026年/2027年博士申请
已经有4人回复
-
26年博士申请自荐-电催化
已经有3人回复
-
中国地质大学（北京）博士招生补录，数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业
已经有6人回复
-
收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评
已经有4人回复
-
考博
已经有5人回复
-
26年申博自荐-计算机视觉
已经有4人回复
-
药化及相关博士的申请
已经有3人回复
-
一篇MDPI论文改变了学习工作和生活
已经有4人回复