| 查看: 567 | 回复: 0 | ||
fanghongmei金虫 (初入文坛)
|
[求助]
mmpbsa.pl计算结合自由能时出错
|
|
各位前辈： 本人最近在学习amber官网上关于用mmpbsa计算结合自由能的一个例子（http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial3/）。 当我做到这一步时：$AMBERHOME/bin/mm_pbsa.pl extract_coords.mmpbsa > extract_coords.log，出现了下面的出错信息： Use of uninitialized value in concatenation (.) or string at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 22. Can't locate mm_pbsa_global.pm in @INC (@INC contains: /src/mm_pbsa /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/site_perl /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/5.8.8 .) at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 23. BEGIN failed--compilation aborted at /usr/local/amber10/bin/mm_pbsa.pl line 23. 这是为什么呢？实在是想不明白，求高手指点，先谢谢大家啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
为什么国自然不能直接公布
已经有5人回复
-
梦想
已经有7人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有8人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有15人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有11人回复
5