应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 晶体结构有空腔，level A错误
61/1返回列表
查看: 1513  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jianglinglei

金虫 (正式写手)

[求助] 晶体结构有空腔，level A错误 已有2人参与

各位大神们好！
      我做了一个天然产物的晶体，换了不同溶剂做了两次样，一直都有level A的问题。我想问问大家（1）遇到了这样的情况怎么处理，因为是做这个分子的晶型研究，所以数据是要尽量体现晶体真实情况，像“squeeze”这样的语句是不能用的；（2）如果确实无法解决这个空腔的问题，那么，大家平时有没有看过文献就这一问题进行讨论的，能不能发一些相关的文献给我？
      PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        313 Ang3  
      残余Q值：Q1 0.9；Q2 0.5
      谢谢大家的帮助！祝大家端午节快乐~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-30 14:01:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

地才

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jianglinglei: 金币+10, ★有帮助 2014-05-30 14:51:02
jianglinglei: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-08-25 09:40:16
有溶剂分子在解析时人为的删除了。解决办法：1 squeeze一下，把SQF详情贴到cif末尾。2 重新xl一次，把所有Q峰读取再仔细指认溶剂分子。祝你好运！端午节快乐！
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-05-30 14:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianglinglei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 地才 at 2014-05-30 14:06:11
有溶剂分子在解析时人为的删除了。解决办法：1 squeeze一下，把SQF详情贴到cif末尾。2 重新xl一次，把所有Q峰读取再仔细指认溶剂分子。祝你好运！端午节快乐！

你好，谢谢你的回答。请问一下是把SQZ里面的所有信息都贴进去吗？
我的文件是这样的。
“# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
   1  0.000 -0.158  0.500       384        91 ' '
   2  0.500  0.052  0.500       384        91 ' '
   3  0.368  0.202  0.735        23         2 ' '
   4  0.632  0.202  0.265        23         2 ' '
   5  0.300  0.260  0.535         9         1 ' '
   6  0.700  0.260  0.465         9         1 ' '
   7  0.132  0.702  0.265        23         2 ' '
   8  0.868  0.702  0.735        23         2 ' '
   9  0.200  0.760  0.465         9         1 ' '
  10  0.800  0.760  0.535         9         1 ' '
_platon_squeeze_details
;
;”
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-30 14:35:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jianglinglei: 金币+8, ★有帮助 2014-05-30 14:51:21
jianglinglei: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-08-25 09:39:57
建议用没有使用squeeze的数据，尽量指认出溶剂分子，进行精修。如果实在没办法，再用squeeze，然后把sqz里的内容复制到cif结尾。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2014-05-30 14:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianglinglei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-30 14:43:46
建议用没有使用squeeze的数据，尽量指认出溶剂分子，进行精修。如果实在没办法，再用squeeze，然后把sqz里的内容复制到cif结尾。

你好，谢谢你的回复。我的文件如下。想请问一下，每个数字是什么意思呀？
   1  0.000 -0.158  0.500       384        91 ' '
赞一下 回复此楼
5楼2014-05-30 14:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jianglinglei at 2014-05-30 14:50:15
你好，谢谢你的回复。我的文件如下。想请问一下，每个数字是什么意思呀？
   1  0.000 -0.158  0.500       384        91 ' '...

_platon_squeeze_void_nr                            1
  _platon_squeeze_void_average_x              0.000
  _platon_squeeze_void_average_y             -0.158
  _platon_squeeze_void_average_z              0.500
  _platon_squeeze_void_volume                  384
  _platon_squeeze_void_count_electrons        91
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2014-05-30 18:39:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jianglinglei 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 基金中了 +13 laoda193707 2026-08-06 13/650 2026-08-07 20:33 by tchen18
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭