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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » 在SNP与疾病相关性研究的基础上，如何开展 针对SNP突变功能 的细胞研究
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珊珊1025

铁虫 (小有名气)

[求助] 在SNP与疾病相关性研究的基础上，如何开展 针对SNP突变功能 的细胞研究 已有1人参与

各位虫友，在SNP与疾病相关性研究的基础上，如何开展 针对SNP突变功能 的细胞研究，不是简单的敲除整个基因，而是针对某个点的突变的功能性研究。
现在的基本想法是：1，首先通过实验证明这个突变会影响基因的功能，可以用什么方法？
                                2，通过细胞实验 发现 突变基因的功能改变，该基因的功能是影响神经迁移或突触生长，我可以通过什么指标发现它的功能改变了？比如做冠心病的话，可以用组胺的表达水平来反应，用什么指标可以反应神经迁移能力和突触生长能力的改变呢？
谢谢！
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努力做一只好虫子
1楼 2014-05-30 10:17:48
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+4, 鼓励交流！ 2014-05-31 03:41:04
珊珊1025: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 谢谢！的确不是个简单的问题，从来没接触过这一块儿，还望多多指教~ 2014-05-31 22:34:25
这个问题不是一个简单的问题，我的E-mail：chenwen@biochen.com，欢迎交流。
首先，你这个SNP是否有人报道过（去NCBI dbSNP查查，）？与疾病关联性如何（你的样品数目是否够，关联性是否强？）
再次，你这个SNP位于那里？（基因的内含子区，5'非翻译区，3'非翻译区，编码区）
如果位于编码区是同一突变，还是错义突变，这个突变位于蛋白质的哪个结构域？
然后才是设计实验验证。
首先应该是这个突变对这个基因本身的影响，突变后基因表达是否有改变。然后对上下游基因的表达或相互作用是否有改变（要根据突变的位点预测一下）。还可以继续深入的去做，看你们实验室的能力了。
可以考虑下SNP是否影响miRNA调控等等。
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2楼2014-05-30 23:14:49
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普通回帖

一品书香

银虫 (初入文坛)
您好，我现在遇到相同的问题，即如何验证SNP对功能的影响，请问您是如何解决的！谢谢！期待您的回复！
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3楼2015-01-29 11:41:51
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珊珊1025

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 一品书香 at 2015-01-29 11:41:51
您好，我现在遇到相同的问题，即如何验证SNP对功能的影响，请问您是如何解决的！谢谢！期待您的回复！

不好意思，刚看见。 我还没解决掉呢， 看你就是这方面的专业人士啊， 现在问题解决了吗？
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努力做一只好虫子
4楼2015-03-25 16:30:20
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wyr2006

木虫 (著名写手)
请问楼主，您的问题解决了么？我也是遇到相同的问题，与疾病关联的SNP位于内含子区域
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5楼2015-10-25 18:27:06
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珊珊1025

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wyr2006 at 2015-10-25 18:27:06
请问楼主，您的问题解决了么？我也是遇到相同的问题，与疾病关联的SNP位于内含子区域

没有，我后来没有继续做这一块儿了。
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努力做一只好虫子
6楼2015-10-26 08:47:29
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yecpd37
7楼2017-08-18 02:47:22
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yecpd37
8楼2017-08-18 17:21:40
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yecpd37
9楼2017-08-19 01:47:23
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bnfeuy637
10楼2017-08-19 23:24:00
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