24小时热门版块排行榜    

查看: 3225  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

单子

金虫 (正式写手)

[求助] 种群遗传分化与遗传结构:FST与STRUCTURE分析结果不一致! 已有1人参与

各位虫友好,

本人在一项种群遗传遗传学研究中遇到以下问题:
我们用微卫星标记研究了4个种群(A、B、C、D)的遗传分化与遗传结构。
Arlequin软件分析的FST结果显示A、B、C三个种群间都有极显著的遗传分化(p<0.001),
但基于Bayesian聚类分析(STRUCTURE软件)的结果则显示:A-B聚为一个遗传簇,C-D聚为另一个遗传簇。

主要疑问在于
FST分析显示:A与B间存在极显著的遗传分化,
而STRUCTURE软件则显示:A-B聚在一起,也就是说A与B之间没有显著的遗传分化。

这是为什么呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoxiaobi

新虫 (初入文坛)

楼主,您好,我刚学着用structure,但我的运算结果没有聚类图,这是为什么呢?
9楼2015-08-21 14:45:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

hechuguiqu11

铜虫 (小有名气)

楼主好,我刚学着用Arlequin,请问怎么进行群体分组啊?
2楼2014-06-16 10:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

聚聚聚

新虫 (初入文坛)

★ ★
单子(kx444555代发): 金币+2, 鼓励交流 2014-06-23 08:24:09
structure 软件说明书里有讲到这一点。就是Fst表明有群体分化,但str软件却不一定得到一致的结果。具体原因说明书有一大通,英文的,我也没看懂。你看看说明书吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-06-22 20:53:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_锋

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
单子(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-05 19:09:32
这个问题我也遇到过,比你更气人的是,我用两个软件出来的聚类图还不一样!我导师当时给我的理由是,软件内部的具体参数不同,检验方法也不不同(相信你遇到过不同检验方法差异很大的情况)。所以我们根据自己的侧重点选择就行,毕竟不是学数学的,那些原理都不同!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-06-26 14:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 299求调剂 +5 某某某某位 2026-03-21 5/250 2026-03-23 23:36 by 热情沙漠
[考研] 336求调剂 +4 收到VS 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:02 by macy2011
[考研] 303求调剂 +4 元夕元 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:00 by macy2011
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +5 葵梓卫队 2026-03-18 7/350 2026-03-23 16:26 by lingjue
[考研] 材料与化工考研调剂 +4 孅華 2026-03-22 4/200 2026-03-23 16:13 by 一休哥FU
[考研] 352求调剂 +3 大米饭! 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123!
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
信息提示
请填处理意见