24小时热门版块排行榜    

查看: 3873  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

单子

金虫 (正式写手)

[求助] 种群遗传分化与遗传结构:FST与STRUCTURE分析结果不一致! 已有1人参与

各位虫友好,

本人在一项种群遗传遗传学研究中遇到以下问题:
我们用微卫星标记研究了4个种群(A、B、C、D)的遗传分化与遗传结构。
Arlequin软件分析的FST结果显示A、B、C三个种群间都有极显著的遗传分化(p<0.001),
但基于Bayesian聚类分析(STRUCTURE软件)的结果则显示:A-B聚为一个遗传簇,C-D聚为另一个遗传簇。

主要疑问在于
FST分析显示:A与B间存在极显著的遗传分化,
而STRUCTURE软件则显示:A-B聚在一起,也就是说A与B之间没有显著的遗传分化。

这是为什么呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

单子

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by fly_锋 at 2014-06-26 14:02:03
这个问题我也遇到过,比你更气人的是,我用两个软件出来的聚类图还不一样!我导师当时给我的理由是,软件内部的具体参数不同,检验方法也不不同(相信你遇到过不同检验方法差异很大的情况)。所以我们根据自己的侧重 ...

非常感谢解答。
7楼2014-07-05 15:26:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

hechuguiqu11

铜虫 (小有名气)

楼主好,我刚学着用Arlequin,请问怎么进行群体分组啊?
2楼2014-06-16 10:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

聚聚聚

新虫 (初入文坛)

★ ★
单子(kx444555代发): 金币+2, 鼓励交流 2014-06-23 08:24:09
structure 软件说明书里有讲到这一点。就是Fst表明有群体分化,但str软件却不一定得到一致的结果。具体原因说明书有一大通,英文的,我也没看懂。你看看说明书吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-06-22 20:53:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_锋

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
单子(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-05 19:09:32
这个问题我也遇到过,比你更气人的是,我用两个软件出来的聚类图还不一样!我导师当时给我的理由是,软件内部的具体参数不同,检验方法也不不同(相信你遇到过不同检验方法差异很大的情况)。所以我们根据自己的侧重点选择就行,毕竟不是学数学的,那些原理都不同!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-06-26 14:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:46 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 7/350 2026-08-30 19:45 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:34 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:23 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 6/300 2026-08-30 19:13 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 19:07 by xiangy672
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:53 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:51 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 9/450 2026-08-30 17:56 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 17:47 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 17:45 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 17:34 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见