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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 如何计算晶体中两平面间的距离
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lijl05

木虫 (正式写手)

[求助] 如何计算晶体中两平面间的距离 已有3人参与

晶体中两个分子存在π-π堆积作用，如何计算两平面间的距离呢？用什么软件啊，我自己用diamond试过，但是不知道如何确定面中心原子，求助大家一下
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从容面对
1楼 2014-05-26 20:04:43
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijl05: 金币+5 2014-05-27 08:25:41
在ins文件中添加两行命令，

mpla atom names for plane 1
mpla atom names for plane 2

然后保存ins，xl精修，然后去lst文件里找两个平面的距离或者夹角。
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2楼2014-05-26 21:18:32
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijl05: 金币+3 2014-05-27 08:25:59
引用回帖:
2楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-26 01:18:32
在ins文件中添加两行命令，

mpla atom names for plane 1
mpla atom names for plane 2

然后保存ins，xl精修，然后去lst文件里找两个平面的距离或者夹角。

这里MPLA后面不用加入原子数n么？我以前都是加n的。
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学无止境
3楼2014-05-26 23:40:07
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijl05: 金币+2 2014-05-27 08:26:06
在XP中执行mpln就行,不用加n, 然后根据平面方程中的常数差来确定面间距.
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
4楼2014-05-26 23:56:39
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forever1706

禁虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-05-26 23:40:07
这里MPLA后面不用加入原子数n么？我以前都是加n的。...

哦，是我记得不全，去查了一下shelx-97的说明书，复制如下，多谢cluster8676提醒. 貌似不加也是可以的，平面将于后面所列出的所有原子计算得出。
MPLA na atomnames
A least-squares plane is calculated through the first na of the named atoms, and the equation
of the plane and the deviations of all the named atoms from the plane are listed with estimated
standard deviations (from the full covariance matrix). The angle to the previous least-squares
plane (if any) is also calculated, but some approximations are involved in estimating its esd.
na must be at least 3. If na is omitted the plane is fitted to all the atoms specified.
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5楼2014-05-27 01:19:41
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-26 05:19:41
哦，是我记得不全，去查了一下shelx-97的说明书，复制如下，多谢cluster8676提醒. 貌似不加也是可以的，平面将于后面所列出的所有原子计算得出。
MPLA na atomnames
A least-squares plane is calculated throug ...

多谢forever1706， 我想起来了，我们当时加n,也是有其他目的的。

假如n=4，那么后面可以输入四个或者四个以上的原子，精修之后会得到第五个原子以及之后的所有原子到前面四个原子组成的平面的距离。说的有点乱。。。
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学无止境
6楼2014-05-27 06:48:11
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forever1706

禁虫 (知名作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-05-27 06:48:11
多谢forever1706， 我想起来了，我们当时加n,也是有其他目的的。

假如n=4，那么后面可以输入四个或者四个以上的原子，精修之后会得到第五个原子以及之后的所有原子到前面四个原子组成的平面的距离。说的有点乱。 ...

学习了。
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7楼2014-05-27 15:38:02
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