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agou

金虫 (正式写手)

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[求助] squeeze后还应该做什么已有2人参与

针对cif检查中有下面的这个A类错误，我用了platon中的squeeze命令，用了之后R因子降低的非常明显。
601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 289.00 A**3
因以前没用过squeeze，只是听别人说过，用了之后要在cif和文章正文中做详细说明，忘哪位xdjm能详细讲解一下如何在两个文件中做说明，能提供参考文献就更好了。

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小木虫三戒总理事

1楼 2014-05-21 15:33:43

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xuling321

木虫 (正式写手)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by agou at 2014-05-22 08:07:09
我的sqz文件格式，全copy过来的。
TITL x
CELL 9.8000 12.0315 12.2584 82.42 71.83 77.05
SPGR P-1
# Note: Atoms in Void as Cxxx and Qxxx all others
C101 0.394 0.924 0.424 ! ...

不是sqz
至于为什么没有sqf我不知道。sqf文件为：
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
1 -0.011  0.021  0.000    549       96 ' '
_platon_squeeze_details
;
;