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agou

金虫 (正式写手)

[求助] squeeze后还应该做什么 已有2人参与

针对cif检查中有下面的这个A类错误,我用了platon中的squeeze命令,用了之后R因子降低的非常明显。
601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     289.00 A**3
因以前没用过squeeze,只是听别人说过,用了之后要在cif和文章正文中做详细说明,忘哪位xdjm能详细讲解一下如何在两个文件中做说明,能提供参考文献就更好了。
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小木虫三戒总理事
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xuling321

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
agou: 金币+2, ★★★很有帮助, 为什么,为什么我的没有sqf文件,我只有sqz文件:格式如下: 2014-05-22 08:06:40
agou: 金币+1, 我把下面的这段直接copy过去,check,通不过,提示有语法错误啊 2014-05-22 08:13:39
打开sqf文件,全选,复制到cif文件最后,保存,check,OK!
6楼2014-05-22 01:19:37
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xuling321

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by agou at 2014-05-22 08:07:09
我的sqz文件格式,全copy过来的。
TITL x
CELL    9.8000   12.0315   12.2584     82.42     71.83     77.05
SPGR P-1
# Note: Atoms in Void as Cxxx and Qxxx all others
C101 0.394 0.924 0.424 !        ...

不是sqz
至于为什么没有sqf我不知道。sqf文件为:
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
   1 -0.011  0.021  0.000       549        96 ' '
_platon_squeeze_details
;
;
8楼2014-05-25 15:49:53
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