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agou金虫 (正式写手)
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squeeze后还应该做什么 已有2人参与
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针对cif检查中有下面的这个A类错误，我用了platon中的squeeze命令，用了之后R因子降低的非常明显。 601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 289.00 A**3 因以前没用过squeeze，只是听别人说过，用了之后要在cif和文章正文中做详细说明，忘哪位xdjm能详细讲解一下如何在两个文件中做说明，能提供参考文献就更好了。 |
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 方法和疑问 |
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2楼2014-05-21 15:53:59
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6楼2014-05-22 01:19:37
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我的sqz文件格式，全copy过来的。 TITL x CELL 9.8000 12.0315 12.2584 82.42 71.83 77.05 SPGR P-1 # Note: Atoms in Void as Cxxx and Qxxx all others C101 0.394 0.924 0.424 ! 3.23 eA-3 C102 0.656 0.175 0.502 ! 2.96 eA-3 C103 0.262 0.766 0.391 ! 2.63 eA-3 C104 0.355 0.955 0.327 ! 2.44 eA-3 C105 0.288 0.777 0.467 ! 2.41 eA-3 Q106 0.917 0.827 0.064 ! 2.26 eA-3 C107 0.586 0.048 0.688 ! 2.17 eA-3 Q108 0.124 0.062 0.873 ! 2.05 eA-3 |
7楼2014-05-22 08:07:09
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不是sqz 至于为什么没有sqf我不知道。sqf文件为： # SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF) # Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell # i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume, # Recovered number of Electrons in the Void and # Details about the Squeezed Material loop_ _platon_squeeze_void_nr _platon_squeeze_void_average_x _platon_squeeze_void_average_y _platon_squeeze_void_average_z _platon_squeeze_void_volume _platon_squeeze_void_count_electrons _platon_squeeze_void_content 1 -0.011 0.021 0.000 549 96 ' ' _platon_squeeze_details ; ; |
8楼2014-05-25 15:49:53
