| 查看: 7908 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Primer5里面的false priming令人困惑不已 已有5人参与
|
|||
|
用Primer5设计上下游引物的时候，感觉下游引物不太合适就编辑了一下，哪知编辑过后，false priming栏目里就出现了一个Most stable dimer，可我仔细瞅了瞅，这个dimer不就是下游引物和我的模板链结合在一起的吗，这怎么算是false呢？而且显示其Delta G是-44kcal/mol，我个人感觉Primer5对该引物false priming的判断是错误的，大家觉得呢？ 另外，打开“All”后，还发现了另一个false priming dimer，也就是我编辑过后的引物和模板链其他部位的碱基对应碱基相连接起来了，我就不明白了，我只是把之前的那个下游引物的5’端和3’端各删了一个碱基，难道在我没删那两碱基之前，原本的那个下游引物就不能和模板链的相关部位的碱基连接起来吗？ 感觉Primer5有许多地方让我困惑，之前用其设计了一对引物，他们的cross dimer的Delta G是-5.4kcal/mol，而用oligo7检测了后，mixed oligos的Delta G是-2.5kcal/mol，而且两个软件所生成的the most stable dimer的形式都不一样。 软件一只是用来预测的，其正确性一定不是100%，但是Primer5的false priming一栏让我太过困惑，还希望战友们不吝赐教，相互交流，不断进步！ 谢过！ |
回复此楼» 猜你喜欢
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有84人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
-
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点
已经有0人回复
-
泛 RAS 抑制新思路：大环肽拟似物如何同时牵住突变型与野生型 RAS？
已经有0人回复
-
TYK2/JAK1 双靶点工具化合物 Brepocitinib：激酶选择性、研究进展与实验应用全解析
已经有0人回复
-
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷质控实录：从一张HPLC图谱读懂纯度与稳定性
已经有0人回复
-
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 一段序列设计的同一个引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析结果不一样
已经有4人回复
- 急！基因用PRIMER5翻译出来为什么和密码子不符？
已经有4人回复
- 求助Primer premier 5.0安装后内存不能为read问题
已经有8人回复
- 【分享】dnaman和primer5中文使用手册【已搜索无重复】
已经有15人回复
快乐农夫
木虫 (正式写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 3225.6
- 散金: 200
- 红花: 7
- 帖子: 859
- 在线: 240.9小时
- 虫号: 2379017
- 注册: 2013-03-26
- 性别: GG
- 专业: 观赏园艺学
6楼2014-07-04 05:32:25
快乐农夫
木虫 (正式写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 3225.6
- 散金: 200
- 红花: 7
- 帖子: 859
- 在线: 240.9小时
- 虫号: 2379017
- 注册: 2013-03-26
- 性别: GG
- 专业: 观赏园艺学
2楼2014-05-12 20:01:44
3楼2014-05-12 20:10:24
mojx
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1402.4
- 散金: 105
- 红花: 3
- 帖子: 516
- 在线: 236.9小时
- 虫号: 2083867
- 注册: 2012-10-24
- 性别: GG
- 专业: 林木遗传育种学
4楼2014-05-16 20:25:39
