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cczjkd木虫 (正式写手)
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谁能帮我看看拉曼光谱怎么算啊 已有2人参与
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优化结构正确，频率为正，能量降低。但是拉曼光谱算出来没结果。 g03.o5718是优化文件 其他的是算的拉曼光谱文件。 求大神帮我算一下拉曼光谱。 |
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我的输入部分是这样的： [he@m1 xinzhi]$ vi 2.com %mem=40MW %NprocShared=4 %LindaWorker=c8 %chk=x1.chk # freq=raman guess=read ub3lyp/lanl2dz Title Card Required 0 1 W -0.382297 -1.623006 1.504763 W -0.382297 -1.623006 -1.504763 W 1.934937 0.029132 -1.268484 W 1.934937 0.029132 1.268484 W 1.053234 1.953902 0.000000 W -0.382297 0.809002 -1.871840 W -2.101989 -0.514862 0.000000 W -0.382297 0.809002 1.871840 W -1.877026 1.848687 0.000000 W 1.422455 -2.237964 0.000000 C -3.766676 2.565250 0.000000 O -4.920566 2.885892 0.000000 ~ "2.com" 22L, 599C written [he@m1 xinzhi]$ cp /opt/g03.pbs . [he@m1 xinzhi]$ vi g03.pbs #!/bin/sh ################################################################# #PBS -N g03 #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -l walltime=12:00:00 #PBS -q batch #PBS -V cd $PBS_O_WORKDIR #executable programe MEM=40MW NprocShared=4 FILENAME=2.com ################################################################ export GAUSS_EXEDIR=/opt/g03 export g03root=/opt export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$g03root/g03 export PATH=$GAUSS_EXEDIR:$GAUSS_EXEDIR/linda7.2/opteron-linux-I8/bin:$PATH export GAUSS_SCRDIR=/tmp export LINDA_PATH=$GAUSS_EXEDIR/linda7.2/opteron-linux-I8/bin "g03.pbs" [dos] 54L, 1267C written [he@m1 xinzhi]$ qsub g03.pbs 5763.m1 [he@m1 xinzhi]$ 请大神帮我看看哪里有问题 |
7楼2014-05-14 21:27:19
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我用你的输入文件在单机上进行“opt+freq=raman”计算可以正常结束，结果看上去没有问题。 所以你的问题可能出在服务器端。 log文件我附上来了，你要用的话就拿去用吧。 |
cczjkd8楼2014-05-15 08:29:27
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