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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 谁能帮我看看拉曼光谱怎么算啊
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cczjkd

木虫 (正式写手)

[求助] 谁能帮我看看拉曼光谱怎么算啊 已有2人参与

优化结构正确，频率为正，能量降低。但是拉曼光谱算出来没结果。

g03.o5718是优化文件  其他的是算的拉曼光谱文件。 求大神帮我算一下拉曼光谱。
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  • 附件 1 : g03.o5718.log
    • 2014-05-12 10:21:23, 714.62 K
  • 附件 2 : g03.o5719.log
    • 2014-05-12 10:21:39, 11.04 K
  • 附件 3 : g03.o5733.log
    • 2014-05-12 10:21:39, 100.28 K

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1楼 2014-05-12 10:23:09
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
不是很懂你的意思，什么叫“拉曼没有结果”，你给的两个算拉曼的文件看上去都还在计算中啊。
你算拉曼用的是你优化好的结构吗？
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2楼2014-05-12 11:50:44
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cczjkd

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-05-12 11:50:44
不是很懂你的意思，什么叫“拉曼没有结果”，你给的两个算拉曼的文件看上去都还在计算中啊。
你算拉曼用的是你优化好的结构吗？

不在计算了是输出结果，是优化好的，频率为正 ，能量降低
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3楼2014-05-13 15:24:17
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你把你的输入程序贴出来啊，是不是本身你的命令就有问题啊？
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4楼2014-05-14 00:00:09
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cczjkd at 2014-05-13 15:24:17
不在计算了是输出结果，是优化好的，频率为正 ，能量降低...

但是你给的三个输出文件，只有一个是计算好了，这个里面你本来就没有计算拉曼啊，还有两个都是算到一半的
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5楼2014-05-14 07:42:29
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cczjkd

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-05-14 07:42:29
但是你给的三个输出文件，只有一个是计算好了，这个里面你本来就没有计算拉曼啊，还有两个都是算到一半的...

是的，输出文件都是算一半的，现在好头疼
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6楼2014-05-14 21:12:24
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cczjkd

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by anmin0127 at 2014-05-14 00:00:09
你把你的输入程序贴出来啊，是不是本身你的命令就有问题啊？

我的输入部分是这样的：
[he@m1 xinzhi]$ vi 2.com
%mem=40MW
%NprocShared=4
%LindaWorker=c8
%chk=x1.chk
# freq=raman guess=read ub3lyp/lanl2dz

Title Card Required

0 1
W    -0.382297   -1.623006    1.504763
W    -0.382297   -1.623006   -1.504763
W     1.934937    0.029132   -1.268484
W     1.934937    0.029132    1.268484
W     1.053234    1.953902    0.000000
W    -0.382297    0.809002   -1.871840
W    -2.101989   -0.514862    0.000000
W    -0.382297    0.809002    1.871840
W    -1.877026    1.848687    0.000000
W     1.422455   -2.237964    0.000000
C    -3.766676    2.565250    0.000000
O    -4.920566    2.885892    0.000000

~
"2.com" 22L, 599C written
[he@m1 xinzhi]$ cp /opt/g03.pbs .
[he@m1 xinzhi]$ vi g03.pbs
#!/bin/sh
#################################################################
#PBS -N g03

#PBS -l nodes=1:ppn=4

#PBS -l walltime=12:00:00

#PBS -q batch

#PBS -V
cd $PBS_O_WORKDIR
#executable programe
MEM=40MW
NprocShared=4
FILENAME=2.com
################################################################
export GAUSS_EXEDIR=/opt/g03
export g03root=/opt
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$g03root/g03
export PATH=$GAUSS_EXEDIR:$GAUSS_EXEDIR/linda7.2/opteron-linux-I8/bin:$PATH
export GAUSS_SCRDIR=/tmp
export LINDA_PATH=$GAUSS_EXEDIR/linda7.2/opteron-linux-I8/bin
"g03.pbs" [dos] 54L, 1267C written                           
[he@m1 xinzhi]$ qsub g03.pbs
5763.m1
[he@m1 xinzhi]$
请大神帮我看看哪里有问题
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7楼2014-05-14 21:27:19
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cczjkd: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-05-15 12:31:27
引用回帖:
7楼: Originally posted by cczjkd at 2014-05-14 21:27:19
我的输入部分是这样的：
$ vi 2.com
%mem=40MW
%NprocShared=4
%LindaWorker=c8
%chk=x1.chk
# freq=raman guess=read ub3lyp/lanl2dz

Title Card Required

0 1
W    -0.382297   -1.623006    1.5 ...

我用你的输入文件在单机上进行“opt+freq=raman”计算可以正常结束，结果看上去没有问题。
所以你的问题可能出在服务器端。
log文件我附上来了，你要用的话就拿去用吧。
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  • 附件 1 : ccjk.log
    • 2014-05-15 08:27:25, 198.63 K

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

cczjkd
8楼2014-05-15 08:29:27
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by cczjkd at 2014-05-14 21:27:19
我的输入部分是这样的：
$ vi 2.com
%mem=40MW
%NprocShared=4
%LindaWorker=c8
%chk=x1.chk
# freq=raman guess=read ub3lyp/lanl2dz

Title Card Required

0 1
W    -0.382297   -1.623006    1.5 ...

你这个程序是没有问题的啊，计算可以正常做，是不是服务器的事情呢？你再试试，或者你看看楼上给你上传的附件也可以
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9楼2014-05-15 10:39:52
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cczjkd

木虫 (正式写手)
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引用回帖:
8楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-05-15 08:29:27
我用你的输入文件在单机上进行“opt+freq=raman”计算可以正常结束，结果看上去没有问题。
所以你的问题可能出在服务器端。
log文件我附上来了，你要用的话就拿去用吧。...

真的太感谢了，能加下QQ吗？
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10楼2014-05-15 12:31:20
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