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金虫 (小有名气)

[求助] material studio的morphology模块进行分析,不支持无限配位聚合物怎么办

各位大神,我想用Materials Studio的Morphology模块来进行一下模拟,材料是一种金属和有机配体形成的无限配位聚合物,但是算的时候软件说不支持无限的体系,但是我看文献上确实有算成功的例子,该怎么处理呢?Morphology模块是不是只能算分子晶体这种有限的体系?第二个问题,在具体算的时候力场选择好了之后,是选择自动标记原子还是其他的?原子的电荷,之间的键是自动还是手动加上?非常感谢
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mylogo: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-04-28 09:14:22
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2014-04-28 09:22:11
引用回帖:
7楼: Originally posted by mylogo at 2014-04-28 09:02:54
我这个晶体是最经典的MOF材料:HKUST(或者Cu3(BTC)2)(Science,1999,283,1148)。cif文件我一会想办法传上去

报错.png
...

非要用growth 、equilibrium算那就按我第二个方法来

MOF材料 建立比5*5*5稍大的晶胞 把MOF结构放进去 所有方向封端
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
10楼2014-04-28 09:09:04
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mylogo: 金币+5, 有帮助 2014-04-28 08:05:47
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2014-04-28 18:39:17
growth morph和equi morph有很多限制,具体去查help,BFDH可以用

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-04-28 05:35:07
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mylogo

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-28 05:35:07
growth morph和equi morph有很多限制,具体去查help,BFDH可以用

BFDH是可以算,但是感觉误差有点大,所以想算一下equi morph,结果算不了,不知道该怎么办。谢谢!
3楼2014-04-28 08:06:59
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

最好给出具体的提示错误的图。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-04-28 08:49:32
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