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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » material studio的morphology模块进行分析，不支持无限配位聚合物怎么办
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mylogo

金虫 (小有名气)

[求助] material studio的morphology模块进行分析，不支持无限配位聚合物怎么办

各位大神，我想用Materials Studio的Morphology模块来进行一下模拟，材料是一种金属和有机配体形成的无限配位聚合物，但是算的时候软件说不支持无限的体系，但是我看文献上确实有算成功的例子，该怎么处理呢？Morphology模块是不是只能算分子晶体这种有限的体系？第二个问题，在具体算的时候力场选择好了之后，是选择自动标记原子还是其他的？原子的电荷，之间的键是自动还是手动加上？非常感谢
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1楼 2014-04-27 22:26:15
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mylogo: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-04-28 09:14:22
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-04-28 09:22:11
引用回帖:
7楼: Originally posted by mylogo at 2014-04-28 09:02:54
我这个晶体是最经典的MOF材料：HKUST（或者Cu3（BTC）2）（Science,1999,283,1148）。cif文件我一会想办法传上去

报错.png
...

非要用growth 、equilibrium算那就按我第二个方法来

MOF材料 建立比5*5*5稍大的晶胞 把MOF结构放进去 所有方向封端
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
10楼2014-04-28 09:09:04
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mylogo: 金币+5, ★有帮助 2014-04-28 08:05:47
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-04-28 18:39:17
growth morph和equi morph有很多限制，具体去查help，BFDH可以用

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-04-28 05:35:07
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mylogo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-28 05:35:07
growth morph和equi morph有很多限制，具体去查help，BFDH可以用

BFDH是可以算，但是感觉误差有点大，所以想算一下equi morph，结果算不了，不知道该怎么办。谢谢！
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3楼2014-04-28 08:06:59
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
最好给出具体的提示错误的图。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-04-28 08:49:32
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