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WSXP1104

新虫 (小有名气)

[求助] 提取肉中微生物基因组用什么方法好?用试剂盒的话,什么试剂盒好? 已有2人参与

提取肉中微生物基因组用什么方法好?用试剂盒的话,什么试剂盒好?
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
匀浆法           10g碎肉样于80mL灭菌离心管中,加入30mL灭菌生理盐水,冰浴条件下用高速匀浆器6500r/min匀浆30s[10],将肉样转移入灭菌锥形瓶中,继续加入60mL灭菌生理盐水,轻轻摇匀,静置5min。所得的混浊液200×g离心1min,取15mL上清液,12000 × g离心5min。
细菌DNA提取  采用细菌DNA提取试剂盒,方法稍作调整。上述离心所得沉淀,加入200μL Buffer S悬浮,加入20μL溶菌酶(50mg/mL),混匀,37℃孵育1h,加入30μL蛋白酶K(20mg/mL),混匀,55℃孵育2~3h,然后继续按试剂盒操作说明进行。提取的DNA溶于80μL的TE缓冲液,1.2%琼脂糖凝胶电泳检测后,-20℃冻存。
可参考:巢​氏​p​c​r​-​-​-​冷​却​猪​肉​不​同​前​处​理​对​细​菌​D​N​A​提​取​及​P​C​R​_​D​G​G​E​的​影​响 作者:江 芸
曾经有人问我为什么要学微生物,我只是想离生命的本质更近一点。
2楼2014-04-20 14:53:13
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WSXP1104

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoamuchong at 2014-04-20 14:53:13
匀浆法           10g碎肉样于80mL灭菌离心管中,加入30mL灭菌生理盐水,冰浴条件下用高速匀浆器6500r/min匀浆30s,将肉样转移入灭菌锥形瓶中,继续加入60mL灭菌生理盐水,轻轻摇匀,静置5min。所得的混浊液200×g离 ...

我所要研究肉中微生物的多样性,即要提取所有微生物的DNA,

看到文献都是:研究肉中微生物的多样性,但是用细菌DNA试剂盒提取。
3楼2014-04-22 08:58:52
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以提总DNA先,用fastprep之类的都可以
致良知
4楼2014-04-23 00:11:32
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