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为什么基因在ensembl上的位置和Entrez上的位置不一样 已有1人参与
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runx1 在ensemble 的位置是http://asia.ensembl.org/Homo_sap ... 5;t=ENST00000358356 Chromosome 21: 36,160,098-37,376,965 reverse strand. runx1 在Entrez的位置是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/861 Chromosome: 21; NC_000021.9 (34787801..35049334, complement) 而且两者不属于包含关系，为什么呢？ 并且我下了Affymetrix外显子数据，发现runx1的位置在35082151-35343335，跟上述位置也是不包含关系，这样子我就查不了哪个外显子对应的是哪个位置呢？ 求大神解答！ [ Last edited by wizardfan on 2014-4-20 at 00:21 ] |
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【答案】应助回帖
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你给的链接无效。 不过根据所提供的发表日期， 2006年，这个太老了 GRCh37 Release date: March 3, 2009 GRCh38 Release date: December 24, 2013 劝你用38的数据，慢慢地大家都会转移到这个版本上来 参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/assembly/grc/human/ |
6楼2014-04-22 05:00:48
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http://www.affymetrix.com/support/mas/index.affx?hightlight=true&rootCategoryId=34001 不好意思，可能得通过上述连接才能进入，打开该网页后选择（Human Exon 1.0 ST Array）下面勾选（Annotation Files），然后点击“go”，则打开另外一个网页，找到HuEx-1_0-st-v2 Probeset Annotations, CSV, Release 20 (41 MB, 7/20/06) Comprehensive collection of annotations documented for each probeset on the NetAffx website in the csv format 另外，谢谢你的建议， 顺便问一下怎么把金币给你呢? |
7楼2014-04-22 23:29:23
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