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1164028932

金虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 906
帖子: 29
在线: 50.4小时
虫号: 1819416
注册: 2012-05-15
性别: GG
专业: 无机非金属基复合材料

[求助] materials-studio软件计算氧气分子能量。已有3人参与

步骤如下：
   1、先构建一个3D Atomistic文件（即构建一个3D物件视窗）；2、在Build——>Crystals——>Build Crystals，这样就构建出了一个立方晶格空间。这个你肯定会。3、Build——>Add Atoms——>选择O原子，在把xyz坐标改为0.5、0.5、0.5，这样就在立方晶格中央构建出了一个O原子，你再用添加原子的笔在那个O原子上加上去一个O原子，就构建出了可以计算氧分子能量的模型。4、单独计算O原子的话，不再添加第二个O原子就行。

计算结果：我用这种方法算了氧气分子能量。castep文件中final energy=-866eV，是看这个数据吗？还是看其他的。谢谢了（看别人计算的，还有文献上给的能量大约都是8~9ev）

castep文件：

*********************************** Forces ***********************************
*                                                                         *
*                      Cartesian components (eV/A)                      *
* -------------------------------------------------------------------------- *
*                x                   y                   z             *
*                                                                         *
* O       1    -0.00085             0.00568          -0.00079       *
* O       2    0.00085          -0.00568             0.00079       *
*                                                                         *
******************************************************************************

***************** Stress Tensor *****************
*                                              *
*       Cartesian components (GPa)          *
* --------------------------------------------- *
*          x          y          z    *
*                                              *
*  x    -0.018289    0.002225    -0.000730  *
*  y    0.002225    -0.006909    -0.006006  *
*  z    -0.000730    -0.006006    -0.013130  *
*                                              *
*  Pressure: 0.0128                         *
*                                              *
*************************************************

+------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS
| Step | lambda | F.delta | enthalpy    | <-- min BFGS
+------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS
|  previous  | 0.000000 | 0.000000 |    -866.417494 | <-- min BFGS
| trial step | 1.000000 | 0.000000 |    -866.417497 | <-- min BFGS
+------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS

BFGS: finished iteration    4 with enthalpy= -8.66417497E+002 eV

+-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS
| Parameter |    value    | tolerance | units | OK? | <-- BFGS
+-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS
|  dE/ion | 1.577937E-006 | 5.000000E-006 |       eV | Yes | <-- BFGS
|  |F|max | 5.800782E-003 | 1.000000E-002 |    eV/A | Yes | <-- BFGS
|  |dR|max  | 3.427978E-005 | 5.000000E-004 |       A | Yes | <-- BFGS
| Smax | 1.828935E-002 | 2.000000E-002 |       GPa | Yes | <-- BFGS
+-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS

BFGS: Geometry optimization completed successfully.

================================================================================
BFGS: Final Configuration:
================================================================================

                        -------------------------------
                                    Unit Cell
                        -------------------------------
      Real Lattice(A)             Reciprocal Lattice(1/A)
  10.0007554 0.0004342 0.0009489       0.6282711  -0.0000273  -0.0000596
0.0004342  10.0010894 0.0018433    -0.0000273 0.6282501  -0.0001158
0.0009489 0.0018433  10.0034738    -0.0000596  -0.0001158 0.6281004

                     Lattice parameters(A)    Cell Angles
                  a = 10.000755       alpha = 89.978882
                  b = 10.001090       beta  = 89.989128
                  c = 10.003474       gamma = 89.995024

            Current cell volume = 1000.531886 A**3

                        -------------------------------
                                 Cell Contents
                        -------------------------------

         xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
         x  Element Atom       Fractional coordinates of atoms  x
         x          Number          u       v       w    x
         x----------------------------------------------------------x
         x  O          1       0.515446 0.528133 0.552192 x
         x  O          2       -0.515446  -0.528133  -0.552192 x
         xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

BFGS: Final Enthalpy    = -8.66417497E+002 eV
BFGS: Final <frequency>  =    1.14214 cm-1
BFGS: Final bulk modulus unchanged from initial value

结构图

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1楼 2014-04-14 21:16:47

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hs0218

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DDr.

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【答案】应助回帖

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1164028932: 金币+25, ★★★很有帮助, 很感谢 2014-04-24 19:00:36

我是做晶体的，没有算过分子，但是我看你这个帖子还是大致知道你的问题在哪
首先你说的这个9eV左右的O2的能量是VASP算出的总能
800多的CASTEP算出来的，没错吧？
vasp的总能是减去了体系单个原子能量后的能量，所以和CASTEP的总能不具有直接可比性！

我搜了下坛子里算O2的帖子，见附件！以此印证我的看法，你CASTEP计算的结果没错！

附图引自：http://muchong.com/html/201111/3868195.html