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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 无序体系的建模问题
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small_grass

银虫 (小有名气)

[求助] 无序体系的建模问题 已有3人参与

模拟无序体系，其中有Li1.4RuO3,有四个锂的位置，各占0.7。不知道该怎么建立模型,想用castep算一下能带和态密度,甚是头大。恳请各位大神指点一二。
data for   ICSD #78722
Coll Code   78722
Rec  Date   1997/05/13
Chem Name   Lithium Ruthenium Oxide (1.4/1/3)
Structured  Li1.4 Ru O3
Sum         Li1.4 O3 Ru1
ANX         A8B11X24
D(calc)     5.05
Title       Structure and lithium deintercalation of Li2-x Ru O3
Author(s)   Kobayashi, H.;Kanno, R.;Kawamoto, Y.;Tabuchi, M.;Nakamura, O.;Tanako,
            M.
Reference   Solid State Ionics
            (1995), 82, 25-31
Unit Cell   4.9398(6) 8.6271(10) 9.9353(8) 90. 99.262(9) 90.
Vol         417.88
Z           8
Space Group C 1 2/c 1
SG Number   15
Cryst Sys   monoclinic
Pearson     mS43
Wyckoff     f4 e3 d
R Value     .0865
Red Cell    C  4.939 4.970 9.935 85.412 80.737 60.204 208.942
Trans Red   -1.000 0.000 0.000 / -0.500 -0.500 0.000 / 0.000 0.000 1.000
Comments    No data on SOF(Li) given; x,y,z(O2) not consistent with
            listed distances
            Total SOF on at least one site differs from unity (SOF <
            0.997 resp. SOF > 1.003)
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-085-2001
            Rietveld profile refinement applied
            X-ray diffraction (powder)
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(U)   
Ru   1  +4.6  8 f   0.237(2)    0.0843(8)   0.0012(15)     1.         0        0.17(14)
Li   1  +1    4 d   0.25        0.25        0.5            0.7        0        0.17(14)
Li   2  +1    4 e   0           0.09(6)     0.25           0.7        0        0.17(14)
Li   3  +1    4 e   0           0.41(7)     0.25           0.7        0        0.17(14)
Li   4  +1    4 e   0           0.72(3)     0.25           0.7        0        0.17(14)
O    1  -2    8 f   0.132(11)   0.25(2)     0.120(3)       1.         0        0.17(14)
O    2  -2    8 f   0.122(15)   0.577(1)    0.100(4)       1.         0        0.17(14)
O    3  -2    8 f   0.128(15)   0.923(15)   0.129(4)       1.         0        0.17(14)
*end for    ICSD #78722
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温柔要有，但不妥协，要在安静中，不慌不忙的刚强
1楼 2014-04-12 15:40:44
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small_grass

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-13 09:44:22
你在晶体结构数据库中导出你要模型的体材料的cif文献，然后倒入MS，在MS中，你要什么空位，就删除什么原子。你要间隙的，就在间隙中加入你想加入的原子。若是不会操作，可以看看MS使用教程。...

呀，我想您还没搞清楚，这个体系很复杂，要建一个超大晶胞，不是删除那么简单。有很多种空位位置，有很多种模型。您可以试一试。
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温柔要有，但不妥协，要在安静中，不慌不忙的刚强
6楼2014-04-13 16:02:49
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:29:13
你给出的就是cif文件的格式，直接在MS中打开就是。然后3D  操作，你想做什么模型都可以。
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2楼2014-04-13 00:19:00
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small_grass

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-13 00:19:00
你给出的就是cif文件的格式，直接在MS中打开就是。然后3D  操作，你想做什么模型都可以。

那您知道这是一个有空位的模型，直接导入肯定不能算。也不适合用vca.请教可否具体说说怎么建空位模型，不惜赐教！
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温柔要有，但不妥协，要在安静中，不慌不忙的刚强
3楼2014-04-13 09:27:17
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:29:23
引用回帖:
3楼: Originally posted by small_grass at 2014-04-13 09:27:17
那您知道这是一个有空位的模型，直接导入肯定不能算。也不适合用vca.请教可否具体说说怎么建空位模型，不惜赐教！...

你在晶体结构数据库中导出你要模型的体材料的cif文献，然后倒入MS，在MS中，你要什么空位，就删除什么原子。你要间隙的，就在间隙中加入你想加入的原子。若是不会操作，可以看看MS使用教程。
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4楼2014-04-13 09:44:22
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