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金虫 (初入文坛)

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[交流] 拓扑分析软件综合对比

结构拓扑分析已经在MOFs研究中盛行，多款拓扑分析软件也应用而生。看到网上也有了很多的介绍，但都比较分散。根据我个人的一些使用经验对它们做一综合的介绍：
1。Topos 4.0 (http://www.topos.ssu.samara.ru/)
个人认为功能最强大，最完整的拓扑分析软件。该网站上附有详细的使用说明文件，简单易懂。该软件不仅针对穿插结构分析，并能给出完整的schlafli符号以及符合RCSR(http://rcsr.anu.edu.au) 的网络分类。更重要的是它对氢键网络的拓扑分析有独到之处。
2. Systre 1.0.0 (http://gavrog.org/)
M. O'Keeffe推荐的软件，精致小巧，基于Java平台，网络分析前需要先编辑相关的结构信息。个人认为没有一定的结构化学基础比较难使用该软件。该软件能直接给出coordination sequence和网络类型，但是不能给出完整的schlafli符号。
3。OLEX (http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/lcells/olex_index.htm)
拓扑分析和绘图的上佳软件，能给出完整的schlafli符号，但是不能分析网络类型。个人认为该程序对高核簇合物的拓扑分析有其优势。
4。Diamond 2.0 & 3.0
似乎不能将其归为拓扑分析软件，但其强大的绘图功能能很好的辅助理解拓扑分析。我经常利用上面几种软件来分析结构拓扑，而利用diamond软件来输出网络图形，相辅相成。

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