24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2580  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zjfjirsm

金虫 (初入文坛)

[交流] 拓扑分析软件综合对比

结构拓扑分析已经在MOFs研究中盛行,多款拓扑分析软件也应用而生。看到网上也有了很多的介绍,但都比较分散。根据我个人的一些使用经验对它们做一综合的介绍:
1。Topos 4.0 (http://www.topos.ssu.samara.ru/)
   个人认为功能最强大,最完整的拓扑分析软件。该网站上附有详细的使用说明文件,简单易懂。该软件不仅针对穿插结构分析,并能给出完整的schlafli符号以及符合RCSR(http://rcsr.anu.edu.au) 的网络分类。更重要的是它对氢键网络的拓扑分析有独到之处。
2. Systre 1.0.0 (http://gavrog.org/)
   M. O'Keeffe推荐的软件,精致小巧,基于Java平台,网络分析前需要先编辑相关的结构信息。个人认为没有一定的结构化学基础比较难使用该软件。该软件能直接给出coordination sequence和网络类型,但是不能给出完整的schlafli符号。
3。OLEX (http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/lcells/olex_index.htm)
   拓扑分析和绘图的上佳软件,能给出完整的schlafli符号,但是不能分析网络类型。个人认为该程序对高核簇合物的拓扑分析有其优势。
4。Diamond 2.0 & 3.0
   似乎不能将其归为拓扑分析软件,但其强大的绘图功能能很好的辅助理解拓扑分析。我经常利用上面几种软件来分析结构拓扑,而利用diamond软件来输出网络图形,相辅相成。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

crystalsnet

新虫 (正式写手)

您给的网址无法进入

Systre 1.0.0 (http://gavrog.org/)
3楼2008-03-03 08:38:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

crystalsnet

新虫 (正式写手)

您的总结非常简洁,但是又很实用
没研究过Systre 1.0.0 ,下载下来研究一下,谢谢
2楼2008-03-03 08:34:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjfjirsm

金虫 (初入文坛)

4楼2008-03-03 09:15:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemeuro

银虫 (正式写手)

olex比较容易学,但给不了已知的拓扑
topos功能强大,我不会
diamond做出的图比较漂亮
这两个月要好好学习下topos怎么用?
楼主能不能给点经验和建议或是教程?
5楼2008-03-03 11:16:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +6 yexuqing 2026-04-19 7/350 2026-04-23 12:32 by yexuqing
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +18 花田半亩~白 2026-04-21 18/900 2026-04-23 11:31 by 12021227
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见