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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp结构弛豫，任务自动终止，求指点！
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)

博众彩之长

[求助] vasp结构弛豫，任务自动终止，求指点！ 已有2人参与

running on    4 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    4 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Pt
POSCAR found :  1 types and   16 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
rank 1 in job 1  buct-mnode12_54396   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 1: return code 174
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君子生非异也，善假于物也
1楼 2014-04-09 21:16:15
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digghost

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cumt蝈蝈: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-04-11 08:20:43
引用回帖:
2楼: Originally posted by digghost at 2014-04-09 21:49:54
你的堆的太小，ulimit -s。看看堆多大。再用ulimit -s unlimited将堆射到无穷大

你的Vasp不会用你的全部内存,而是使用一个特定大小的内存存储你的一个数组,这特定大小的内存就叫堆.如果你的系统中电子数量超过一定值,对导致存储电子状态的数组超过了堆的大小,所以VASP报错,停止运算.而你将sys=0或者降低计算精度,或者缩小体系中原子数量都可以减小存储电子状态的数组的大小,因此可以继续计算.但是这是牺牲精度的基础上.系统默认的堆通常比较小,所以你的看系统管理器的时候会发现还有很多内存没用.
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呵呵了
7楼2014-04-10 17:02:58
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digghost

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cumt蝈蝈: 金币+2, ★有帮助 2014-04-09 22:14:23
你的堆的太小，ulimit -s。看看堆多大。再用ulimit -s unlimited将堆射到无穷大

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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呵呵了
2楼2014-04-09 21:49:54
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)

博众彩之长
引用回帖:
2楼: Originally posted by digghost at 2014-04-09 21:49:54
你的堆的太小，ulimit -s。看看堆多大。再用ulimit -s unlimited将堆射到无穷大

“你的堆的太小”不明白，再有我的其他类似的体系都能正常运算，唯独纯Pt体系有问题！
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君子生非异也，善假于物也
3楼2014-04-09 22:14:12
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)

博众彩之长
这个任务是我分步弛豫的第二步，第一步可以正常运行收敛。但是如果不分步，也可以正常运行，这是怎么回事？求指点！
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君子生非异也，善假于物也
4楼2014-04-10 09:32:03
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