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guoshukuan

铜虫 (小有名气)


[交流] vasp 弛豫 运算中止

在用VASP进行弛豫时,没有收敛就中止了,不知是什么原因,请高手指点,谢谢。report报错如下:(INCAR附后)

  2 F= -.51222436E+03 E0= -.51220567E+03  d E =-.287127E-02  mag=     6.5571
BRION: g(F)=  0.220E-02 g(S)=  0.000E+00 retain N=  1 mean eig= 1.28
eig:   1.281
bond charge predicted
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1    -0.512224664499E+03   -0.51222E+03   -0.26952E-01 33192   0.733E-01    0.415E-01
RMM:   2    -0.512228082145E+03   -0.34176E-02   -0.46411E-03 34110   0.146E-01    0.128E-01
RMM:   3    -0.512225929205E+03    0.21529E-02   -0.76357E-04 34873   0.602E-02    0.242E-01
mpiexec_nd13: mpd_uncaught_except_tb handling:
  exceptions.IOError: [Errno 5] Input/output error
    /rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  1073  handle_cli_stderr_input
        sys.stderr.write(msg)
    /rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpdlib.py  776  handle_active_streams
        handler(stream,*args)
    /rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  530  mpiexec
        rv = streamHandler.handle_active_streams(timeout=1.0)
    /rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  1446  ?
        mpiexec()

INCAR;
[lyhua@nd13 87-68]$ cat INCAR
general:
System = Fe and vacancy in sigma3 GB
ISTART = 0 ; ICHARG=2
PREC=Accurate
ENCUT=320
ISMEAR = 0; SIGMA = 0.1
# IALGO  =  48
ALGO=Fast
GGA=91
ISPIN=2
VOSKOWN = 1
AMIX=0.2
BMIX=0.0001
AMIX_MAG=0.8
BMIX_MAG=0.0001
MAGMOM= 93*0 2*4 1*0
LREAL  =  Auto
# NPAR  =  1
# IMAGES=6
NELMIN = 5  
EDIFF  =  1E-5; EDIFFG = -0.01
NSW  =  60; IBRION =  1
MAXMIX=80
NFREE=10
ISIF  =  2
LWAVE  = .F.
LDAU = .TRUE.
LDAUL = -1  2  -1
LDAUU = 0  6.73  0
LDAUJ = 0  1.0   0
[lyhua@nd13 87-68]

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guoshukuan

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by hakuna at 2012-02-16 04:56:03:
先串行跑一下看看....
错误提示里像是MPI的问题

谢谢回复,串行是不是把任务投在一个节点上,我就是串行的啊。下面是我的nodes文件:
nodes:
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
3楼2012-02-16 17:26:22
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普通回帖

hakuna

木虫 (知名作家)



guoshukuan(金币+1):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-16 08:48:42
先串行跑一下看看....
错误提示里像是MPI的问题
2楼2012-02-16 04:56:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)



guoshukuan(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by guoshukuan at 2012-02-16 17:26:22:
谢谢回复,串行是不是把任务投在一个节点上,我就是串行的啊。下面是我的nodes文件:
nodes:
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13

串行怎么可能把mpd、mpi都弄起来了?
4楼2012-02-17 15:48:53
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guoshukuan

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by hakuna at 2012-02-17 15:48:53:
串行怎么可能把mpd、mpi都弄起来了?

我是新手,不太理解你的意思。
5楼2012-02-18 07:51:45
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