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guoshukuan

铜虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
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[交流] vasp 弛豫运算中止

在用VASP进行弛豫时，没有收敛就中止了，不知是什么原因，请高手指点，谢谢。report报错如下：（INCAR附后）

  2 F= -.51222436E+03 E0= -.51220567E+03  d E =-.287127E-02  mag=    6.5571
BRION: g(F)=  0.220E-02 g(S)=  0.000E+00 retain N=  1 mean eig= 1.28
eig: 1.281
bond charge predicted
   N    E                   dE          d eps    ncg    rms       rms(c)
DAV: 1 -0.512224664499E+03 -0.51222E+03 -0.26952E-01 33192 0.733E-01 0.415E-01
RMM: 2 -0.512228082145E+03 -0.34176E-02 -0.46411E-03 34110 0.146E-01 0.128E-01
RMM: 3 -0.512225929205E+03 0.21529E-02 -0.76357E-04 34873 0.602E-02 0.242E-01
mpiexec_nd13: mpd_uncaught_except_tb handling:
  exceptions.IOError: [Errno 5] Input/output error
/rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  1073  handle_cli_stderr_input
      sys.stderr.write(msg)
/rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpdlib.py  776  handle_active_streams
      handler(stream,*args)
/rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  530  mpiexec
      rv = streamHandler.handle_active_streams(timeout=1.0)
/rhome/lyhua/mpich2-ifort11/bin/mpirun  1446  ?
      mpiexec()

INCAR；
[lyhua@nd13 87-68]$ cat INCAR
general:
System = Fe and vacancy in sigma3 GB
ISTART = 0 ; ICHARG=2
PREC=Accurate
ENCUT=320
ISMEAR = 0; SIGMA = 0.1
# IALGO  =  48
ALGO=Fast
GGA=91
ISPIN=2
VOSKOWN = 1
AMIX=0.2
BMIX=0.0001
AMIX_MAG=0.8
BMIX_MAG=0.0001
MAGMOM= 93*0 2*4 1*0
LREAL  =  Auto
# NPAR  =  1
# IMAGES=6
NELMIN = 5
EDIFF  =  1E-5; EDIFFG = -0.01
NSW  =  60; IBRION =  1
MAXMIX=80
NFREE=10
ISIF  =  2
LWAVE  = .F.
LDAU = .TRUE.
LDAUL = -1  2  -1
LDAUU = 0  6.73  0
LDAUJ = 0  1.0 0
[lyhua@nd13 87-68]

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1楼 2012-02-15 19:48:42

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hakuna

木虫 (知名作家)

1ST强帖: 3
应助: 82 (初中生)
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★
guoshukuan(金币+1):谢谢参与

引用回帖:

3楼: Originally posted by guoshukuan at 2012-02-16 17:26:22:
谢谢回复，串行是不是把任务投在一个节点上，我就是串行的啊。下面是我的nodes文件:
nodes:
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13

串行怎么可能把mpd、mpi都弄起来了？

4楼2012-02-17 15:48:53

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hakuna

木虫 (知名作家)

1ST强帖: 3
应助: 82 (初中生)
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帖子: 5599
在线: 1367.2小时
虫号: 167622

★
guoshukuan(金币+1):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-16 08:48:42

先串行跑一下看看....
错误提示里像是MPI的问题

2楼2012-02-16 04:56:03

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guoshukuan

铜虫 (小有名气)

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虫号: 1495985

引用回帖:

楼: Originally posted by hakuna at 2012-02-16 04:56:03:
先串行跑一下看看....
错误提示里像是MPI的问题

谢谢回复，串行是不是把任务投在一个节点上，我就是串行的啊。下面是我的nodes文件:
nodes:
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13
nd13

3楼2012-02-16 17:26:22

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guoshukuan

铜虫 (小有名气)

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楼: Originally posted by hakuna at 2012-02-17 15:48:53:
串行怎么可能把mpd、mpi都弄起来了？

我是新手，不太理解你的意思。

5楼2012-02-18 07:51:45

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