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tennisafin

木虫 (正式写手)

[交流] 为什么我的PCR跑出来的都是二聚体?

年前在上海生工合成了一对SCAR引物,在群体中具有很好的多态性,稳定性也很好。但是过完年,回来一跑PCR,什么产物都没有,只有二聚体,但偶尔跑的不错。不知道为什么???
引物一直是保存在—20C°
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wuyexu1205

金虫 (小有名气)

我认为相对而言,胶和试剂影响你结果的可能性很小,到是同意3楼和1楼的看法。也就是说问题应该出在模版和酶的方面。因为:PCR试剂在分子上讲都是化学稳定结构,这是作为试剂的一个基本前提;你一个研究生倒不好琼脂糖胶是不可能的;对于TAQ酶,不同的公司的产品的技术规格不同,PCR技术总体上属于敏感性实验技术,TAQ酶虽然耐高温,但是对化学物质敏感,最怕污染,有可能是问题的根源;对于模板,就要看你严谨的程度了,如果是手抽质粒或其他DNA(RNA更是如此)作为模板,其中有很多抽提时残留的杂质,包括未除尽的蛋白,如果在习惯性的4度冰箱存放,这些导致你的模板的降解是完全可能的,更何况放置了一个寒假,你做PCR实验想必对模板进行了稀释,拿一份降解的模板稀释前又不弹匀的话,是符合你“有时做出来,有时做不出来”的情形的。
满招损,谦受益
9楼2008-03-02 13:04:07
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dreamsail

银虫 (正式写手)

★ ★
asr(金币+2,VIP+0)::P 多谢,欢迎常来交流!
我遇到这样的问题一般把酶和DNTP都换新的,你试下看。
2楼2008-03-01 10:29:40
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ganchao1776

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
asr(金币+2,VIP+0)::P very good,欢迎常来交流!
你说的情况可以肯定不是引物的问题,如果2楼的因素排除后,最大的可能是就是模板了,我个人认为dNTP的可能性最小!!
3楼2008-03-01 19:25:08
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lauren180

木虫 (著名写手)

小木虫挖井人

★
asr(金币+1,VIP+0)::P
模板问题,做新模板吧
细推物理须行乐。
4楼2008-03-01 19:39:59
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