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tanshuai

银虫 (小有名气)

[求助] 怎样用sybyl进行HDACi 的对接

本人用sybyl对HDAC抑制剂进行分子对接时,发现原本ligand与蛋白中Zn原子应形成的配位键,一直没有出现。对于这类活性位点含金属原子的蛋白为受体的对接是否需要进行特殊设置?有什么需要特别注意的地方?求各位有经验的大神赐教!
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好好学习,天天向上
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qq0317

铜虫 (小有名气)

同问!我也是最近在查以金属离子作为辅因子的酶为受体的对接是否需要保留金属离子,或者加上一些金属-配体的相互作用限制。
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2楼2015-10-20 11:10:20
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