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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiaohehc371

铁虫 (初入文坛)

[交流] [交流求助] 有做过RT-PCR的同志请进来一下,请教些问题

我想确定我的基因中是否有内含子,所以就想做一下RT-PCR,上网查了一些资料,但还是不知道改怎么做,我计划用试剂盒,但有些问题:
1、同一基因的RT-RCP的引物和PCR的引物是一样的吗?若不同,RT-PCR的引物应如何设计(最好不要用软件)?
2、用试剂盒的话,是不是还要自己先提取mRNA?
3、在实验过程中应该注意什么?
4、我的基因序列已知,那我做RT-PCR大约需要多长时间?
5、是不是有一种竞争性RT-PCR可以定量分析基因在细胞中的表达水平?我是否可以与RT-PCR一同做了?
6、我们实验室的试剂盒放了有两年了,是不是不能用了?
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xiaohehc371

铁虫 (初入文坛)

我就是根据NCBI上的全基因序列设计的引物,但是因为此菌的全基因组序列已经测出,所以这个基因的序列是推测出的,怎么能看出它是否有内含子啊?
4楼2008-02-29 10:47:39
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annwt

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
asr(金币+3,VIP+0)::P 多谢分享宝贵经验,常来交流!
如果我没有理解错,你应该作过基因组的PCR,怀疑基因比目前得到的序列短。是否有内含子,如果为找内含子,你应该先到NCBI的EST比对你的序列就知道是否有内含子了。至于你的问题,我的建议是:
1,应该熟悉软件设计引物,这是基本功。
2,你的RT试剂盒应该是包括mRNA提取。放两年的试剂盒应该太久了,如果还要进这种试剂盒的话,用它练习试验,熟悉操作过程还是可以的。
3,定量PCR比较贵,建议试验没有设计周密前不要作。
最后,分子生物学试验要快可快,要是不出结果,也很正常,愿你多来这里交流,分享你的快乐与问题。

[ Last edited by annwt on 2008-2-28 at 17:30 ]
2楼2008-02-28 17:28:56
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coldspringzhang

银虫 (初入文坛)

看看挺有收获的
明天试验考试 考的就是RT-PCR
3楼2008-02-28 20:54:52
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playboy723

金虫 (正式写手)

呵呵 又一个菜鸟  是学生物的还是学医的?
好好把那些资源网站熟悉一下  要想知道有无内含子是很简单的   不用做PCR   比对一下就可以了。
5楼2008-02-29 15:23:08
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