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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiaohehc371

铁虫 (初入文坛)

[交流] [交流求助] 有做过RT-PCR的同志请进来一下,请教些问题

我想确定我的基因中是否有内含子,所以就想做一下RT-PCR,上网查了一些资料,但还是不知道改怎么做,我计划用试剂盒,但有些问题:
1、同一基因的RT-RCP的引物和PCR的引物是一样的吗?若不同,RT-PCR的引物应如何设计(最好不要用软件)?
2、用试剂盒的话,是不是还要自己先提取mRNA?
3、在实验过程中应该注意什么?
4、我的基因序列已知,那我做RT-PCR大约需要多长时间?
5、是不是有一种竞争性RT-PCR可以定量分析基因在细胞中的表达水平?我是否可以与RT-PCR一同做了?
6、我们实验室的试剂盒放了有两年了,是不是不能用了?
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annwt

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
asr(金币+3,VIP+0)::P 多谢分享宝贵经验,常来交流!
如果我没有理解错,你应该作过基因组的PCR,怀疑基因比目前得到的序列短。是否有内含子,如果为找内含子,你应该先到NCBI的EST比对你的序列就知道是否有内含子了。至于你的问题,我的建议是:
1,应该熟悉软件设计引物,这是基本功。
2,你的RT试剂盒应该是包括mRNA提取。放两年的试剂盒应该太久了,如果还要进这种试剂盒的话,用它练习试验,熟悉操作过程还是可以的。
3,定量PCR比较贵,建议试验没有设计周密前不要作。
最后,分子生物学试验要快可快,要是不出结果,也很正常,愿你多来这里交流,分享你的快乐与问题。

[ Last edited by annwt on 2008-2-28 at 17:30 ]
2楼2008-02-28 17:28:56
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coldspringzhang

银虫 (初入文坛)

看看挺有收获的
明天试验考试 考的就是RT-PCR
3楼2008-02-28 20:54:52
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xiaohehc371

铁虫 (初入文坛)

我就是根据NCBI上的全基因序列设计的引物,但是因为此菌的全基因组序列已经测出,所以这个基因的序列是推测出的,怎么能看出它是否有内含子啊?
4楼2008-02-29 10:47:39
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playboy723

金虫 (正式写手)

呵呵 又一个菜鸟  是学生物的还是学医的?
好好把那些资源网站熟悉一下  要想知道有无内含子是很简单的   不用做PCR   比对一下就可以了。
5楼2008-02-29 15:23:08
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ganchao1776

至尊木虫 (职业作家)

处处小心,不如粗中有细,这就是我做分子一年多从没有失手过的一点小体会

不知道你的试剂盒是那个公司的,我们实验室有个上学期用放了两年以上的试试剂盒照样钓出基因来了

试剂盒有自己的说明书,有要获得mRNA的一步,体很容易,如果引物设计并完成合成,那么你的情况有4天足可以把你的基因钓出来,但是有一个算是技巧的东西你要知道:每一次反转录PCR后的产物电泳的亮带都带有长长的尾巴,有的时候可能会整个泳道都是亮的,这是正常现象,你要在你基因大小的地方割胶回收,然后以这个产物为模板重新批,多重复几次就会出来了

另外,把你的菌培养到表达你的目的基因的阶段也是关键
6楼2008-03-02 15:22:49
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