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qiaotang

新虫 (初入文坛)

[求助] dmol3界面的参数怎么设置啊,以及几何优化的问题 已有1人参与

1、如图,这个界面有一个 use  symmetry 选项,这个是做什么用的?
2、旁边有个charge参数,我用几何优化的时候,如果不选设置这个的话就会报错,请问这个是做什么用的呢,应该怎么设置呢?
3、计算的精度选择,course,medium。。。究竟误差大概是多少呢?

4、老师让我们手动改晶格参数,然后计算能量,找到最低的能量点这样优化结构。我想问的是,这个和软件自带的几何优化有区别吗?

我是新手,只有一点点金币,谢谢大家啦!!!!

dmol3界面的参数怎么设置啊,以及几何优化的问题
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liebegll

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
qiaotang: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-09 13:39:36
1 如果你的体系有明显的对称性或者你的计算需要对称性,那么需要勾选;
2 charge是电荷,为什么会报错需要你提供具体报错信息;
3 个人认为Dmol3优化最好在fine以上,coarse和medium一般不选;
4 我认为如果是做界面化学最好使用软件优化晶胞,得到晶胞参数。
2楼2014-04-02 22:30:35
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

1、体系有对称性,采用对称性可以根据对称性减小计算量来加快速度,但是有时候也有可能造成一些特殊问题(因为优化过程限定了对称性),所以大部分情况还是不采用的。

2、charge指的是体系的静电荷,比如一分子OH-在Cu(1 0 0)(如4x4x6)表面的吸附的参考体系,那么整个的参考体系的静电荷就是-1.这个需要看体系的实际情况。

3、详细情况未做过测试,从scf收敛来讲,coarse和fine的精度差了一个数量级,建议选择fine ,低精度反倒是容易引起不收敛,当然前提建立在离opt structure比较近,否则一来scf不容易收敛,二来优化需要的时间较长。我们组的测试来看大致上medium定性基本正确。

4、优化bulk structure一般不建议用Dmol3,我做过测试,直接opt cell的话geom opt的convergence如果在1e-5和1e-7的晶格常数差别非常大,感觉很不可靠。另外这种情形计算速度未必比castep快,所以既不快又不准,推荐这样的情况别用dmol3,否则(我自己的经验上)cleave后的surface可能计算的时候很难收敛。如果是只通过能量来判断geom opt显然不合理,force收敛更重要(至少从gaussian等程序来看,force这项很重要)。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-04-02 23:18:02
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