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gzbs

木虫 (正式写手)

[求助] 金属原子命名 已有4人参与

我有一个单晶测试解析完后发现有一个金属原子命名有问题,里面只有一个Zn原子,可是命名为Zn2,我想把它改为Zn1,
可是我没有XShell怎么也改不过来,请问哪位虫友能帮我把Zn2原子改为Zn1原子?本人在此不胜感激。
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  • 2014-04-02 10:56:15, 102.2 K

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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gzbs: 金币+2, ★有帮助 2014-04-02 11:31:18
你可以手动改,不用shelxtl,记事本有替换功能,你将Zn2替换为Zn1即可,因为只是改个名,不会对其他的键长,键角,位移参数,Ueq等造成影响。
2楼2014-04-02 11:20:57
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gzbs

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jackdeng at 2014-04-02 11:20:57
你可以手动改,不用shelxtl,记事本有替换功能,你将Zn2替换为Zn1即可,因为只是改个名,不会对其他的键长,键角,位移参数,Ueq等造成影响。

谢谢,但是ins和FCF文件里面的怎么改呢?
3楼2014-04-02 11:31:08
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
gzbs: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-02 15:12:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by gzbs at 2014-04-02 11:31:08
谢谢,但是ins和FCF文件里面的怎么改呢?...

一样啊,你用记事本将ins打开后,将Zn2改为Zn1.FcF是结构因子数据,里面的任何数据是不能随意改动的,它里面也不涉及你说的这个问题,无须改动。
4楼2014-04-02 12:40:10
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gzbs: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-04-02 15:10:41
楼主晶胞里有一个水分子无序,注意还需要精修一下。在ins里把Zn2改成Zn1,再XL一下就改好了,或者xp里name Zn2 Zn1就可以了。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
5楼2014-04-02 13:05:38
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userhung

禁虫 (文学泰斗)

木虫博士

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gzbs: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-02 15:12:37
用记事本替换就可以的哦~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
6楼2014-04-02 14:58:16
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gzbs

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-02 13:05:38
楼主晶胞里有一个水分子无序,注意还需要精修一下。在ins里把Zn2改成Zn1,再XL一下就改好了,或者xp里name Zn2 Zn1就可以了。

您好,我不会用XP精修,通常我用的XShell解晶体,您能帮我精修一下吗
7楼2014-04-02 15:12:20
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xja1830

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gzbs at 2014-04-02 15:12:20
您好,我不会用XP精修,通常我用的XShell解晶体,您能帮我精修一下吗...

配合物我没解过,改编号容易,处理无序复杂点。让xi老师帮你弄下吧!无序是必需要处理的。你做过checkcif吗?建议做个看还有那些问题,一次解决。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
8楼2014-04-02 15:27:16
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羊倌

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by gzbs at 2014-04-02 11:31:08
谢谢,但是ins和FCF文件里面的怎么改呢?...

http://1000eb.com/v8aa
准备架人
9楼2014-04-02 15:41:04
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gzbs

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-02 15:27:16
配合物我没解过,改编号容易,处理无序复杂点。让xi老师帮你弄下吧!无序是必需要处理的。你做过checkcif吗?建议做个看还有那些问题,一次解决。...

xi老师是哪位呢?我不认识,能告诉我他联系方式吗?check后只有c类错误
Alert level C
PLAT048_ALERT_1_C MoietyFormula Not Given ........................     Please Do !
PLAT077_ALERT_4_C Unitcell contains non-integer number of atoms ..     Please Check
PLAT125_ALERT_4_C No '_symmetry_space_group_name_Hall' Given .....     Please Do !
PLAT165_ALERT_3_C Nr. of Status R Flagged Non-Hydrogen Atoms .....          2      
PLAT417_ALERT_2_C Short Inter D-H..H-D       H5D    ..  H7D     ..       2.14 Ang.  
PLAT911_ALERT_3_C Missing # FCF Refl Between THmin & STh/L=  0.595         32 Why ?
PLAT975_ALERT_2_C Check Calcd Residual Density  1.06A From      O6       0.54 eA-3  
PLAT976_ALERT_2_C Check Calcd Residual Density  0.95A From      O6      -0.66 eA-3  
PLAT976_ALERT_2_C Check Calcd Residual Density  0.83A From      O5      -0.44 eA-3
10楼2014-04-02 15:52:28
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