应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS用建立海水模型，总是会有水分子或者Na、Cl离子直接成键！！！
51/1返回列表
查看: 1236  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wuyoulang

新虫 (初入文坛)

[求助] MS用建立海水模型，总是会有水分子或者Na、Cl离子直接成键！！！ 已有2人参与

如题，
1.自己建水晶格为3A的大小，放氯钠后build一下就成键了，位置难道只能自己一个个放好才能保证不成键么？
2.用AC模块建好的盒子放入400个水8个Na+和Cl-，能量最小化的时候会出现水分子间自己成键，比如一个水分子的HH连起来了。。。
3.我键的水分子模型键长键角都固定了，放到AC中建出来的用discover模块的minilmizer跑了800步之后。。键长键角都变得乱七八糟了。
希望有人能帮我解决。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-04-01 14:56:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-04-02 19:59:44
H2O照理是不会乱的 最好是设置好水的模型，比较常用的是TIP3P模型
Na+与Cl-之间相互吸引也是合理的

请问在MS中怎么设置水的TIP3P模型，原谅我的低级问题
赞一下 回复此楼
逆风奔跑。
6楼2014-07-09 23:38:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-04-07 09:46:08
wuyoulang: 金币+3 2014-04-07 22:49:49
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

CQU_wjq
2楼2014-04-02 19:59:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huachao90

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-04-07 09:46:16
wuyoulang: 金币+2 2014-04-07 22:49:56
本帖内容被屏蔽
3楼2014-04-03 07:40:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyoulang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-04-02 19:59:44
H2O照理是不会乱的 最好是设置好水的模型，比较常用的是TIP3P模型
Na+与Cl-之间相互吸引也是合理的

额，我自己用超胞建立水分子的时候，然后把cl ，na离子复制过来，水的晶格还存在 。如果不再重新建晶格就没事，重新建晶格就成键了。有人说不用rebuild crystal可以直接能量最小化，这个有影响么？
赞一下 回复此楼
4楼2014-04-03 10:23:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 07化学280分求调剂 +3 722865 2026-03-23 3/150 2026-03-23 18:48 by macy2011
[考研] 生物学一志愿985，分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生（材料、化学、电化学，环境） +3 我爱学电池 2026-03-23 3/150 2026-03-23 17:16 by AZMK
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 0854电子信息求调剂 +3 α____ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:28 by zhq0425
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 生物学调剂招人！！！ +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭