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262413748

新虫 (小有名气)

[求助] 新手求助,输入文件出错,麻烦看下 已有2人参与

gaus新手刚接触学习了,在实际操作结构优化时有两个问题请教:
1,想做结构优化,看看取代基对分子构型的影响,这样可以吗?是直接OPT+FREQ还是先算能量最低再优化?
2,输入文件出错(输入文件是在view里构型然后Cal选择输入信息的),出错信息是:severe error message #2070  The processing of the last link ended abnormally. All processing has been aborted.
下面是输入文件内容,请大家指正下,谢谢!!!

%chk=C:\Users\lenovo\Desktop\pdic12br.chk
%mem=500MB
#p b3lyp/3-21g** opt freq=norama

pdic12br

0 1
C                 -7.55839842   -5.96516455   -1.84073548
C                 -5.45055842   -4.73291355   -1.84073548
C                 -6.18698542   -3.50813255   -1.84055948
C                 -7.59543342   -3.53314455   -1.84067248
C                 -8.26381342   -4.79196955   -1.84073248
C                 -4.02166642   -4.70753955   -1.84068748
C                 -5.49450842   -2.25799055   -1.84019148
C                 -4.06561142   -2.23260555   -1.83979748
C                 -3.32919042   -3.45738455   -1.84008748
C                 -6.22040142   -1.05074355   -1.83998048
C                 -7.64476442   -1.10132655   -1.84029048
C                 -8.30807842   -2.29883955   -1.84059648
H                 -8.20090142   -0.15138955   -1.84022148
H                 -8.08046542   -6.93424555   -1.84074148
C                 -3.29578642   -5.91477755   -1.84111348
C                 -1.87142042   -5.86419155   -1.84108048
C                 -1.20810542   -4.66667955   -1.84023648
C                 -1.92075342   -3.43238155   -1.83967948
H                 -1.31528842   -6.81412255   -1.84157748
C                 -1.95779942   -1.00034455   -1.83826348
H                 -1.43573542   -0.03124355   -1.83725648
C                 -1.25237642   -2.17354455   -1.83867148
C                 -9.80378528   -4.80127875   -1.84072968
O                -10.30145913   -6.14188334   -1.84098907
O                -10.39236151   -1.02211533   -1.83802613
C                 -9.84741008   -2.34420466   -1.84080774
Br                -4.16482387   -7.42002354   -1.84129031
Br                -5.35137278    0.45450740   -1.83932683
C                  0.33122605   -4.62130881   -1.83988672
C                  0.28759507   -2.16419481   -1.83804611
O                  1.01260134   -5.72996076   -1.84039622
O                  0.92914974   -1.03203385   -1.83712327
N                  1.05891287   -3.26407965   -1.83893521
C                  1.57399399   -3.62838252   -1.12514957
C                  3.08071199   -3.62837254   -1.12514612
H                  1.17948717   -4.27980764   -1.94217740
H                  1.17955930   -4.01044578   -0.15251671
C                  3.63831174   -5.02052858   -0.91553627
H                  3.45790550   -3.21869896   -2.09936400
H                  3.45429873   -2.96749974   -0.29876978
H                  3.26113722   -5.43019099    0.05866172
H                  3.26107908   -5.69885670   -1.72592104
C                  5.17831173   -5.02049996   -0.91560271
C                  5.70267828   -6.43302920   -0.91566771
H                  5.53101462   -4.46878988   -0.01075937
H                  5.53083807   -4.46885534   -1.82057737
C                  7.21657322   -6.46580482   -0.91591200
H                  5.31833417   -6.97809461   -0.01323148
H                  5.33523947   -6.96789417   -1.83115991
C                  7.74091909   -7.87835880   -0.91591200
H                  7.60091082   -5.92076208   -1.81833023
H                  7.38823054   -8.42993137   -0.01095733
H                  7.38790750   -8.43005335   -1.82066633
C                  9.28091904   -7.87862368   -0.91618393
C                  9.80501907   -9.29117083   -0.90105663
H                  9.63384842   -7.31723619   -0.01740156
H                  9.63342701   -7.33685638   -1.82711316
C                 11.31890776   -9.32423498   -0.90114849
H                  9.42069423   -9.82638068    0.00726747
H                  9.43735552   -9.83582644   -1.81066729
C                 11.84298712  -10.73680617   -0.88595592
H                 11.70322609   -8.78904761   -1.80945434
H                 11.70371427   -8.76947247   -0.00486756
H                 11.49031694  -11.27850160    0.02495257
H                 11.48974905  -11.29817710   -1.78464941
C                 13.38298694  -10.73736673   -0.88643016
H                 13.74010764  -10.22362319   -0.01842533
H                 13.73928944  -11.74624264   -0.87557010
H                 13.73956318  -10.24262384   -1.76562459
N                -10.73953351   -3.42495964   -1.84334104
C                -11.62808949   -3.62330649   -2.99747569
C                -13.07025626   -3.53571554   -2.57006257
H                -11.40886977   -4.62355110   -3.44354545
H                -11.39468488   -2.84176945   -3.76055359
C                -14.01147458   -3.73613263   -3.73920467
H                -13.27916711   -4.31119639   -1.78635755
H                -13.26706677   -2.52488612   -2.12429662
C                -15.45364907   -3.64860011   -3.31174923
H                -13.80257801   -2.96066608   -4.52288795
H                -13.81675543   -4.73741247   -4.20683712
H                -15.68689808   -4.43010365   -2.54859028
H                -15.67267051   -2.64840321   -2.86543073
C                -16.38474941   -3.85615684   -4.52070430
C                -17.82684299   -3.76982145   -4.09278909
H                -16.16500435   -4.85594182   -4.96754532
H                -16.15209545   -3.07392843   -5.28330287
C                -18.76828613   -3.97003831   -5.26178448
H                -18.03500089   -4.54599198   -3.30956662
H                -18.02418594   -2.75943661   -3.64625127
C                -20.21038738   -3.88376138   -4.83382698
H                -18.56014249   -3.19388210   -6.04498521
H                -18.57304754   -4.97085956   -5.73018143
H                -20.44288573   -4.66595625   -4.07114738
H                -20.42993405   -2.88402415   -4.38673732
C                -21.14171998   -4.09108315   -6.04264345
C                -22.58373699   -4.00564156   -5.61429100
H                -20.92163864   -5.09052305   -6.49009053
H                -20.90963034   -3.30833158   -6.80487708
C                -23.52540494   -4.20565005   -6.78314098
H                -22.79132777   -4.78233532   -4.83143679
H                -22.78142116   -2.99559140   -5.16714738
C                -24.96742957   -4.12026694   -6.35474627
H                -23.31782841   -3.42897063   -7.56597346
H                -23.32983542   -5.20612564   -7.25213793
H                -25.64291618   -4.27042770   -7.23116996
H                -25.19936360   -4.90298494   -5.59243164
H                -25.18731244   -3.12087484   -5.90705063
H                  7.58329133   -5.94600660   -0.05554717
C                 -6.13313642   -5.96516455   -1.84073548
H                 -5.52792830   -6.84756079   -1.84085735
C                 -3.38306142   -1.00034955   -1.83905648
H                 -3.98828433   -0.11796345   -1.83914707

1 5 2.0 14 1.0 109 1.0
2 3 1.0 6 1.0 109 2.0
3 4 2.0 7 1.0
4 5 1.0 12 1.0
5 23 1.0
6 9 1.0 15 2.0
7 8 1.0 10 2.0
8 9 1.0 111 2.0
9 18 2.0
10 11 1.0 28 1.0
11 12 2.0 13 1.0
12 26 1.0
13
14
15 16 1.0 27 1.0
16 17 2.0 19 1.0
17 18 1.0 29 1.0
18 22 1.0
19
20 21 1.0 22 2.0 111 1.0
21
22 30 1.0
23 24 2.0 70 1.0
24
25 26 2.0
26 70 1.0
27
28
29 31 2.0 33 1.0
30 32 2.0 33 1.0
31
32
33 34 1.0
34 35 1.0 36 1.0 37 1.0
35 38 1.0 39 1.0 40 1.0
36
37
38 41 1.0 42 1.0 43 1.0
39
40
41
42
43 44 1.0 45 1.0 46 1.0
44 47 1.0 48 1.0 49 1.0
45
46
47 50 1.0 51 1.0 108 1.0
48
49
50 52 1.0 53 1.0 54 1.0
51
52
53
54 55 1.0 56 1.0 57 1.0
55 58 1.0 59 1.0 60 1.0
56
57
58 61 1.0 62 1.0 63 1.0
59
60
61 64 1.0 65 1.0 66 1.0
62
63
64
65
66 67 1.0 68 1.0 69 1.0
67
68
69
70 71 1.0
71 72 1.0 73 1.0 74 1.0
72 75 1.0 76 1.0 77 1.0
73
74
75 78 1.0 79 1.0 80 1.0
76
77
78 81 1.0 82 1.0 83 1.0
79
80
81
82
83 84 1.0 85 1.0 86 1.0
84 87 1.0 88 1.0 89 1.0
85
86
87 90 1.0 91 1.0 92 1.0
88
89
90 93 1.0 94 1.0 95 1.0
91
92
93
94
95 96 1.0 97 1.0 98 1.0
96 99 1.0 100 1.0 101 1.0
97
98
99 102 1.0 103 1.0 104 1.0
100
101
102 105 1.0 106 1.0 107 1.0
103
104
105
106
107
108
109 110 1.0
110
111 112 1.0
112
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-04-01 15:21:34
262413748: 金币+5, ★★★很有帮助, 辛苦了,谢谢,我再学习下如何计算出来结果,也就是循环问题 2014-04-02 20:32:37
1、opt+freq就是先优化再频率;
2、去拉曼关键词拼错,去看高斯手册。
还是那句话,新手学习先从看高斯手册开始。
2楼2014-04-01 12:38:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxying

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
norama错误,其实输出out文件最后部分一般会给出错误的地方。程序使用过程中不能运行的情况很多,自己找到原因,结合使用说明,力争自己解决。
明天会更好!
3楼2014-04-01 15:55:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-01 12:38:17
1、opt+freq就是先优化再频率;
2、去拉曼关键词拼错,去看高斯手册。
还是那句话,新手学习先从看高斯手册开始。

谢谢!
我后来调试成#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity可以运行,也如您所说拼错了
还有个问题想问您一下,其他都一样,但是计算了一下午了一直在SCF到301等等计算,最后又回到了SCF,这样循环,是没有计算到合适的吗?
4楼2014-04-01 16:48:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lxying at 2014-04-01 15:55:25
norama错误,其实输出out文件最后部分一般会给出错误的地方。程序使用过程中不能运行的情况很多,自己找到原因,结合使用说明,力争自己解决。

恩,这种基础错误不应该犯的。同样想问您一下,#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity 计算,一直在SCF和后续几个程序如L301 302等循环,是计算不到合适的吗?有什么方法可以去寻找解决办法?望指点
5楼2014-04-01 16:50:34
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oyezzy

铁虫 (小有名气)

这分子还真不小。内存500Mb够用吗。view里给出的一般都有geom=connectivity。降低收敛标准可以减少scf循环次数,当然也有可能就不收敛。
初来乍到多多关照
6楼2014-04-01 17:10:09
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262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by oyezzy at 2014-04-01 17:10:09
这分子还真不小。内存500Mb够用吗。view里给出的一般都有geom=connectivity。降低收敛标准可以减少scf循环次数,当然也有可能就不收敛。

谢谢!!!怎么判断大概需要多大内存?确实分子不小,我现在中止了在看OUT文件,希望能找到错误所在。不收敛的话gaus应该会有个自动结束的方法吧?
7楼2014-04-01 17:51:45
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 262413748 at 2014-04-01 16:48:42
谢谢!
我后来调试成#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity可以运行,也如您所说拼错了
还有个问题想问您一下,其他都一样,但是计算了一下午了一直在SCF到301等等计算,最后又回到了SCF,这样循环, ...

这就是计算的方法,一直跑循环和迭代直到到达收敛标准。如果最后没有收敛,程序会报错,输出文件最后也会写。至于你说的需要多少内存,在你不确定的情况下尽量大一点,可以去参考下高斯手册中“估计计算的内存需求”这章
8楼2014-04-02 07:01:51
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oyezzy

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 262413748 at 2014-04-01 17:51:45
谢谢!!!怎么判断大概需要多大内存?确实分子不小,我现在中止了在看OUT文件,希望能找到错误所在。不收敛的话gaus应该会有个自动结束的方法吧?...

在达到最大循环次数(可以自己设定Maxcycle=60,120...等等)仍不收敛的时候就会结束。
初来乍到多多关照
9楼2014-04-02 09:15:36
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262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-02 07:01:51
这就是计算的方法,一直跑循环和迭代直到到达收敛标准。如果最后没有收敛,程序会报错,输出文件最后也会写。至于你说的需要多少内存,在你不确定的情况下尽量大一点,可以去参考下高斯手册中“估计计算的内存需求 ...

恩  好的 谢谢!   我去看看  今天算了一天还是没算到头= =
10楼2014-04-02 20:11:25
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