应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » ChIP实验DNA超声破碎打不断怎么回事？
101/1返回列表
查看: 5966  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

1990_feiyu

新虫 (初入文坛)

[交流] ChIP实验DNA超声破碎打不断怎么回事？ 已有4人参与

如标题啊，我是做蓝藻的，找DNA-蛋白结合位点，可是DNA破碎一步就是做不出来，我是把100ml的菌液（OD730=0.6）回收做细胞破碎，离心上清用实验室的仪器做超声，可就是没反应，超与不超是一样的条带，但是把DNA纯化出来就能超碎，有没有谁知道是为什么呢，是不是我哪一步做错了，一个月了，我是新手，有相关经验的帮忙指点一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-03-31 22:14:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

taojun

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-04 23:10:04
你往菌液里面加点SDS LYSIS BUFFER就可以了
赞一下 回复此楼
2楼2014-05-06 17:24:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng_xu

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-05 19:08:06
可能是你的细胞结构的问题，要么选择裂解细胞，要么就选择增加超生破碎的次数，应该可以吧
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-07 03:47:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feiyu_1990

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-05 19:08:18
引用回帖:
2楼: Originally posted by taojun at 2014-05-06 17:24:53
你往菌液里面加点SDS LYSIS BUFFER就可以了

我是先将细胞破碎完，离心取上清再超声的，前一阵往里加了融膜的Triton X-100，变成部分能超碎了，一部分在下面弥散的带，一部分还是在未超声DNA基因组那，这个是为什么呢？
赞一下 回复此楼
4楼2014-07-04 20:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feiyu_1990

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng_xu at 2014-05-07 03:47:11
可能是你的细胞结构的问题，要么选择裂解细胞，要么就选择增加超生破碎的次数，应该可以吧

我是用机械破碎完细胞取上清超声的，现在只能部分超碎，不知道为什么啊
赞一下 回复此楼
5楼2014-07-04 20:21:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

taojun

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-05 19:08:27
引用回帖:
4楼: Originally posted by feiyu_1990 at 2014-07-04 20:19:46
我是先将细胞破碎完，离心取上清再超声的，前一阵往里加了融膜的Triton X-100，变成部分能超碎了，一部分在下面弥散的带，一部分还是在未超声DNA基因组那，这个是为什么呢？...

出现在基因组地方的条带是因为你没有超声打断一部分基因组，你的超声波力度不大，你的超声波程序是什么呢？
赞一下 回复此楼
6楼2014-07-05 16:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feiyu_1990

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by taojun at 2014-07-05 16:36:22
出现在基因组地方的条带是因为你没有超声打断一部分基因组，你的超声波力度不大，你的超声波程序是什么呢？...

我的程序是10 s，30 s ice，20%功率，型号是东芝JY99-IIDN，其实这个是标配大探头的，我们实验室只有这个仪器，安了个2mm的小探头，是不是仪器的问题，还总是不工作，主机响，能量传不到探头，一换水就好了，我的样品就不行，我们这个破菌的效果都不怎么好，但是把DNA基因组纯化出来超声，效果还是挺好的。蓝藻做7942时也能都打碎，到6803时就不行了，6803膜特别多，几乎是融不完的。
赞一下 回复此楼
7楼2014-07-21 10:46:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

taojun

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by feiyu_1990 at 2014-07-21 10:46:48
我的程序是10 s，30 s ice，20%功率，型号是东芝JY99-IIDN，其实这个是标配大探头的，我们实验室只有这个仪器，安了个2mm的小探头，是不是仪器的问题，还总是不工作，主机响，能量传不到探头，一换水就好了，我的样 ...

说明你的细菌膜太厚了，我的样本是线虫，我的程序是10 on，59.9off，功率是50%，一共20次，我看了条带都是200-800的！
赞一下 回复此楼
8楼2014-07-22 08:59:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

atikou

禁虫
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
9楼2022-03-29 14:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

atikou

禁虫
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
10楼2022-03-29 14:48:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1990_feiyu 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-15 10:52 by xSrQNSSjcgoX
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 4/200 2026-11-15 10:08 by xSrQNSSjcgoX
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-15 08:07 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 XJXMuRjD7cK7 2026-11-13 4/200 2026-11-15 06:50 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 6/300 2026-11-15 02:59 by xSrQNSSjcgoX
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-15 00:35 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-14 21:58 by Equinoxhua
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-13 11:11 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:31 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:03 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:30 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 8/400 2026-11-12 10:16 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-12 09:52 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭