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花神之息

铜虫 (小有名气)

[求助] 一个细胞内大概有多少启动子?(2014/3/30) 已有6人参与

题目很不专业,求原谅。。。
本人没学过生物,但是现在非常需要一些DNA结构,基因表达机理的相关信息。
我是在做这样一项事情:用微分方程及反应动力学等工具模拟目标蛋白的转录及翻译过程。
大概过程是:转录因子与DNA上某个表达位点结合,转录出相应的mRNA,mRNA翻译成蛋白质。
由于是一个半定量模拟,所涉及到的物质必须都以浓度或数量表示,现在遇到的问题是:
DNA上某一种特定基因的结合位点(binding sites),其数量或浓度,是一个什么数量级?
(注:某一种特定基因就是指,比如蛋白质A所对应的基因位点,而不考虑其他蛋白质表达位点。)

急需,在线等啊,求大神。。。
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

一个基因一个启动子,你可以想象一下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-03-30 21:07:09
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 花神之息 at 2014-03-30 21:13:15
DNA/基因、启动子、表达位点这些概念我真的不是很清楚。
不过,根据生物实验文献,我设想的情况大概是这样的:DNA是一根长长的线,线上游很多特定的点,核内转录因子都游离在线的周围,转录因子只有结合到这些点上 ...

转录因子是DNA上的序列,你还是找本书好好看看吧

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-03-30 21:19:16
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-30 21:19:16
转录因子是DNA上的序列,你还是找本书好好看看吧
...

不好意思,给你说错了

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-03-30 21:21:31
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-30 21:21:31
不好意思,给你说错了
...

刚才脑袋犯傻,以为你说的是启动子

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2014-03-30 21:22:18
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 花神之息 at 2014-03-30 21:13:15
DNA/基因、启动子、表达位点这些概念我真的不是很清楚。
不过,根据生物实验文献,我设想的情况大概是这样的:DNA是一根长长的线,线上游很多特定的点,核内转录因子都游离在线的周围,转录因子只有结合到这些点上 ...

还有这个基因的表达在不同的细胞和不同的时间上都是不一样的

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-03-30 21:24:26
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
11楼: Originally posted by 花神之息 at 2014-03-30 21:28:06
嗯,cell-type-specific and sensitive to gene microenvironment.但是做模拟不能面面俱到,只能非常粗略的简化处理。。。...

这样的话,我觉得你最好先选定你的研究对象吧

[ 发自小木虫客户端 ]
12楼2014-03-30 21:33:13
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