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用vasp优化Ni2团簇出现的问题！ 已有1人参与
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各位前辈，大家好： 最近用vasp优化Ni2团簇，将Ni2放到边长为13的立方体盒子中，Ni，Ni 键长为2.42，KPOINTS，gamma下的kmesh不知道取多少， Automatic generation Gamma - - - 0.0 0.0 0.0 于是就分别取2到13进行KPOINTS的收敛性测试，取到9还正常，但没有收敛，但从10开始，机器计算出现异常，如下：-------------------------------------------------------- JOBID: 46876.cn061 The job was started at Thu Mar 27 11:48:27 CST 2014 The job was running at cn012. k mesh = 10 x 10 x 10 running on 4 nodes distr: one band on 1 nodes, 4 groups vasp.5.2.12 26May11 complex POSCAR found type information on POSCAR Ni POSCAR found : 1 types and 2 ions LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup FFT: planning ...( 1 ) WAVECAR not read -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that process rank 0 with PID 16304 on node cn012 exited on signal 9 (Killed). -------------------------------------------------------------------------- real 1m4.034s user 0m14.805s sys 0m11.433s k mesh = 11 x 11 x 11 running on 4 nodes distr: one band on 1 nodes, 4 groups vasp.5.2.12 26May11 complex POSCAR found type information on POSCAR Ni POSCAR found : 1 types and 2 ions LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup FFT: planning ...( 1 ) WAVECAR not read -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that process rank 0 with PID 16324 on node cn012 exited on signal 9 (Killed). 。。。 这是怎么回事？望高手指导，感激不尽！  |
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emilyoyang
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【答案】应助回帖
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小小鑫000: 金币+3 2014-04-01 18:06:51
小小鑫000: 金币+3 2014-04-01 18:06:51
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“团簇之间隔多远就没相互作用了” 具体的视情况而定，for instance cluster大小会影响box的大小， 你的Au13按照我的感觉15A 的距离应该可以的，但好像计算量有点大喔！ 我在jacs上看到很多ClusterAu/TiO2的理论计算工作，你可以搜一下相关的文章，上面有对模型的详细阐述。另外，也有碰到过文章不考虑cluster-cluster interaction（就是两个周期的中的cluster相距非常近<5埃），这个感觉跟研究对象或侧重点有关。 但我个人还是认为 计算能力允许前提下， cluster-cluster尽可能的远。 |
15楼2014-04-01 17:59:28
emilyoyang
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