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cham208

木虫 (正式写手)

[求助] CIF有B类错误,求帮忙修改 已有1人参与

很早前的一个晶体,最近投稿审稿人说有B类错误,请高手帮忙修改,不胜感激!
可发我邮箱:fxdmlzm@163.com

错误如下:
PLAT029_ALERT_3_B   _diffrn_measured_fraction_theta_full Low ....... 0.959 Note
PLAT222_ALERT_3_B   Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio
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  • 2014-03-27 10:43:44, 649.27 K

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forever1706

禁虫 (知名作家)

引用回帖:
13楼: Originally posted by p452_1 at 2014-03-29 20:39:51
首先声明我不是行家,很多相关的知识和术语还不懂。
我觉得分辨率在cif文件中写在文件的下方。比如_diffrn_reflns_theta_full        25.00,相当于分辨率为0.84埃。
这个分辨率个人觉得会影响到Rint值,通过改变 ...

其实我也测过,但是对其中的原理知之甚少,比如为什么_diffrn_reflns_theta_full        25.00,相当于分辨率为0.84埃。我的那个数据在prp文件中找到的是lowest resolution = 16.16 Angstroms,而在cif中对应的_diffrn_reflns_theta_full              28.56 ,问题是16.16和0.84这两个分辨率完全不搭边。
关于吸收校正,我也不懂,是在数据还原的那步做吗? 您说的一个事让我想起来了,我有一个数据,本来一直角度不够,才23度的样子,后来负责数据收集和还原的老师通过改分辨率把这个角度提高了,我理解是把分辨率提高,本来的弱点都当成噪音,所以高角度没点,这样改分辨率之后,那些弱点也都算衍射点了,但是损失了一点R值,不过还好那个质量也过得去,修完后就没有AB类错误了。

这个Hirshfeld test diff我经常遇到,以前有时候是B类都没去管,投文章也就那么过了。真心不懂怎么彻底明白这个问题的原因和对策。

总之,谢谢你的耐心回复和不吝赐教。
14楼2014-03-30 00:29:41
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix
2楼2014-03-27 16:16:31
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cham208

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ljmmarise at 2014-03-27 16:16:31
少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix

我找不到hkl文件了,还有其它办法吗?多谢
3楼2014-03-27 16:42:04
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
cham208: 金币+50, ★有帮助 2014-03-27 19:38:53
需要找到数据文件hkl文件和fcf文件等,在ins文件中加入适当的命令,进行精修。有可能去掉这2个B类问题。
老歪博
4楼2014-03-27 18:32:03
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