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Miss_33310

新虫 (初入文坛)

[求助] 我用MAGA4.0画的系统发育树~~是不是有问题??? 已有1人参与

各位~本人最近在做新种鉴定的工作,用MAGA4.0画了三种不同的数,前两个分别是Neighbour-joining phylogenetic tree和Minimum-evolution phylogenetic tree,画出来看起来挺正常的 但是最后一个Maximum-parsimony  phylogenetic tree 为什么画出来我自己的菌跑到最后,不同属的那个反而在中间 我们实验室还没有出现过这样的属,一般最下面的应该是离的最远的那个属的菌呀...
或者这种情况也是正常的??
请大家帮忙看一下吧~~
数在我上传的word文件里~~谢谢各位了!
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  • 附件 1 : 系统发育树.doc
  • 2014-03-26 19:08:22, 83.5 K

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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Miss_33310: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-27 15:20:18
很简单,可以再选邻近属,拿几个序列作为亚外群,再添加一个更远的作为外群,还有,一般画树不用minimu那个,而是Maxium Likelihood树~画树是技术活~多练习就O了
2楼2014-03-27 01:55:06
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

补充一句,都用MEGA 5了,你咋还用MEGA 4.
3楼2014-03-27 01:55:45
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Miss_33310

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-27 01:55:06
很简单,可以再选邻近属,拿几个序列作为亚外群,再添加一个更远的作为外群,还有,一般画树不用minimu那个,而是Maxium Likelihood树~画树是技术活~多练习就O了

我试试看啊~~
4楼2014-03-27 10:14:51
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