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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

[求助] MS模块的选择 已有2人参与

请教MS高手,如果是做吸附,应该选择哪个模块,有的论文用的discover,有的用amorphous,有的用sorption,有的用compass,我想研究孔道中吸附,解吸附,扩散,研究对象为非周期性非晶态有机大分子,希望高手帮忙深入分析各个模块的优势劣势,帮助选择,谢谢!
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厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
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voleyes

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-25 20:41:04
如果是做分子动力学的话用discover
2楼2014-03-25 14:30:54
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
discover是基于分子动力学(MD)的模块;
Sorption是基于蒙特卡洛(MC)的模块;基于MC的算法,可计算的体系比MD的大,但相比精度低一些;
amorphous只是构建模型的模块,在实质性计算开始前可能会使用;
compass只是众多力场中的一种,应用于基于分子动力学的模块
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2014-03-25 16:47:00
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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-03-25 19:47:00
discover是基于分子动力学(MD)的模块;
Sorption是基于蒙特卡洛(MC)的模块;基于MC的算法,可计算的体系比MD的大,但相比精度低一些;
amorphous只是构建模型的模块,在实质性计算开始前可能会使用;
compas ...

谢谢您!明白了一些,那如果我想算几百到几千个原子的模型,模型类似于活性炭,计算其中气体吸附,扩散性质,discover和Sorption哪个更好些呢?谢谢您!
厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
4楼2014-03-25 17:29:29
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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-03-25 19:47:00
discover是基于分子动力学(MD)的模块;
Sorption是基于蒙特卡洛(MC)的模块;基于MC的算法,可计算的体系比MD的大,但相比精度低一些;
amorphous只是构建模型的模块,在实质性计算开始前可能会使用;
compas ...

如果是做吸附等温线,算吸附能呢?
厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
5楼2014-03-25 17:30:25
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
阡陌蔓: 金币+30 2014-03-26 08:33:27
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阡陌蔓 at 2014-03-25 17:29:29
谢谢您!明白了一些,那如果我想算几百到几千个原子的模型,模型类似于活性炭,计算其中气体吸附,扩散性质,discover和Sorption哪个更好些呢?谢谢您!...

Sorption ,专做吸附的。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
6楼2014-03-25 17:59:56
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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-03-25 20:59:56
Sorption ,专做吸附的。...

好的 ,斑竹,我先探索下,不懂再来麻烦您
厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
7楼2014-03-26 08:34:02
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