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请问β-actin基因是单拷贝基因吗 已有1人参与
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biostar2009
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
061719: 金币+5 2014-03-20 09:59:03
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061719: 金币+5 2014-03-20 09:59:03
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就当你说的是人， 人的ACTB基因在基因组上只有一个位置，这个你可以去genome browser上看到，NM_001101.3 但是，这类高丰都高保守的基因往往在基因组中还存在大量各种原因产生的假基因。 比如，就用NM_001101.3这段序列在genome browser上blat，会发现大量高度相似的基因组区间： BLAT Search Results ACTIONS QUERY SCORE START END QSIZE IDENTITY CHRO STRAND START END SPAN --------------------------------------------------------------------------------------------------- browser details YourSeq 1807 1 1812 1852 100.0% 7 - 5566779 5570232 3454 browser details YourSeq 1554 1 1801 1852 93.3% 5 + 77080627 77082421 1795 browser details YourSeq 1455 1 1815 1852 90.9% 18 + 60109157 60110952 1796 browser details YourSeq 1452 61 1817 1852 92.5% 1 - 224050841 224052577 1737 browser details YourSeq 1447 1 1829 1852 90.7% 6 - 88985006 88986792 1787 browser details YourSeq 1446 77 1809 1852 92.2% 2 + 132021121 132022848 1728 browser details YourSeq 1438 77 1809 1852 92.0% 2 - 131219797 131221524 1728 browser details YourSeq 1434 77 1809 1852 91.9% 2 + 131414315 131416042 1728 browser details YourSeq 1427 77 1808 1852 92.3% 2 - 130831226 130832952 1727 browser details YourSeq 1422 77 1809 1852 91.7% 2 + 132383704 132385430 1727 browser details YourSeq 1421 61 1820 1852 92.2% 22 - 41469568 41471267 1700 browser details YourSeq 1415 24 1798 1852 91.0% 15 - 44280683 44282443 1761 browser details YourSeq 1412 77 1809 1852 91.2% 14 + 19584790 19586517 1728 browser details YourSeq 1405 77 1809 1852 91.3% 14 - 19987119 19988846 1728 browser details YourSeq 1399 77 1809 1852 91.0% 22 - 16254760 16256484 1725 browser details YourSeq 1399 61 1809 1852 91.3% 9 + 6834432 6836166 1735 browser details YourSeq 1380 21 1809 1852 90.9% 9 + 103493457 103495571 2115 browser details YourSeq 1352 1 1820 1852 89.9% 5 + 97674364 97676124 1761 browser details YourSeq 1326 20 1822 1852 90.8% 5 - 79594903 79598731 3829 browser details YourSeq 1314 52 1809 1852 89.6% 11 - 1823099 1825405 2307 browser details YourSeq 1308 9 1822 1852 89.6% 3 - 175694693 175696448 1756 browser details YourSeq 1298 109 1809 1852 90.0% 5 - 130994133 130995784 1652 …………………… 仔细看，这些高度相似的区间的一个特征就是，没有intron，也就是说大多数都是由反转录型的转座。 |
2楼2014-03-19 20:36:07