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vithey

银虫 (小有名气)

[求助] 请教基因拷贝数的单位及算法

各位虫友大家好，紧急求助！
       首先说明，我也做土壤微生物，然后用的是总DNA进行荧光定量
       想问一下看到文献里边写氨氧化细菌的数量为1.4*105（=140000）   copies/g干土
       我认为这儿的数量是指基因拷贝数，但是我看到的公式是这样的，


       我的专业跟生物差距很远，实在基础浅薄，在此麻烦专业人士告诉我一下是不是公式有错误，给指正一下或者给个正确的公式行吗？
       我是用的1uL DNA定量然后得到Ct值算出拷贝数的，这个是最终结果么，怎么从uL转化到g呀，求指导！
       希望大家给解释一下，谢谢啦！大家元旦快乐！
请教基因拷贝数的单位及算法
图片1.jpg
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1楼 2014-01-01 21:58:42
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vithey

银虫 (小有名气)
各位虫友大家好，紧急求助！
       首先说明，我也做土壤微生物，然后用的是总DNA进行荧光定量
       想问一下看到文献里边写氨氧化细菌的数量为1.4*105（=140000）   copies/g干土
       我认为这儿的数量是指基因拷贝数，但是我看到的公式是这样的，
       我的专业跟生物差距很远，实在基础浅薄，在此麻烦专业人士告诉我一下是不是公式有错误，给指正一下或者给个正确的公式行吗？
       我是用的1uL DNA定量然后得到Ct值算出拷贝数的，这个是最终结果么，怎么从uL转化到g呀，求指导！
       希望大家给解释一下，谢谢啦！大家元旦快乐！
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2楼2014-01-01 22:01:16
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vithey

银虫 (小有名气)
我怎么才能再上传一次我的公式图片呢
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3楼2014-01-01 22:05:51
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vithey

银虫 (小有名气)
质粒原液X ng/μl，阿佛加德罗常数(每mol的微粒数)是6.02×1023/mol，那么每μl的绝对模板数量是: ((X/(2692+497)×660)×10-9×6.02×1023
单位是否应该是copies/uL啊
求解求解
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4楼2014-01-01 22:07:15
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1364449854

新虫 (初入文坛)
我也想知道为什么，lz搞清楚了吗，求告知
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5楼2014-06-09 16:35:57
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dhx13

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 1364449854 at 2014-06-09 16:35:57
我也想知道为什么，lz搞清楚了吗，求告知

我也想知道，怎么从uL转化到g dry soil ？请各位虫友帮忙！！
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6楼2015-02-24 11:54:20
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vithey

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 1364449854 at 2014-06-09 16:35:57
我也想知道为什么，lz搞清楚了吗，求告知

不好意思，好久不上小木虫了。其实很简单，就是把copies/微升DNA转化为提取DNA时对应使用的干土的质量/g。也就是1微升DNA来自多少干土的意思。
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7楼2015-05-06 15:24:06
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vithey

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dhx13 at 2015-02-24 11:54:20
我也想知道，怎么从uL转化到g dry soil ？请各位虫友帮忙！！...

其实很简单，就是把copies/微升DNA转化为提取DNA时对应使用的干土的质量/g。也就是1微升DNA来自多少干土的意思。
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8楼2015-05-06 15:24:34
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