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diligence89

木虫 (小有名气)

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[求助] 请问溶剂极性对分子激发态稳定性的影响怎么计算已有1人参与

如题，我有一个分子，分子内有一个羟基，羟基左边有一个N原子，右边有一个O原子，羟基与N原子形成氢键的话，就是一个六元环；羟基与O原子形成氢键的话，会形成一个五元环；我想知道在激发态羟基是更容易和N、O之间的那个原子形成氢键，以及溶剂极性对氢键的影响。

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1楼 2014-03-12 20:09:57

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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

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专业: 理论和计算化学

楼主是想考察分子处于激发态时是如何形成分子内氢键的，和溶剂效应对这个氢键的影响？
激发态的工作没有做过，只做过基态的，只能说个大概的思路。
思路：分子处于激发态时，进行几何优化，对优化完毕的构型进行分析，看看是N还是O与羟基的H形成氢键，可以从距离直观判断，从能量大小来判断哪个更容易。对优化构型加上个溶剂模型，可以选择PCM，CPCM模型等，哪个模型合适要进行尝试，或者依据文献，或者跟实验值比较来确定。优化完毕后，同上分析。
最后结合NBO和AIM理论来对构型进行分析，说明是某某跟H形成氢键。
操作：在高斯软件中如何进行激发态计算，几何优化等操作，自己要去看高斯手册，遇到问题找小木虫。
既然有氢键，要考虑到弱相互作用，B3LYP显然不太合适。选择合适的方法和基组来计算，这个要自己尝试，或者依据文献。