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diligence89

木虫 (小有名气)

[求助] 请问溶剂极性对分子激发态稳定性的影响怎么计算已有1人参与

如题,我有一个分子,分子内有一个羟基,羟基左边有一个N原子,右边有一个O原子,羟基与N原子形成氢键的话,就是一个六元环;羟基与O原子形成氢键的话,会形成一个五元环;我想知道在激发态羟基是更容易和N、O之间的那个原子形成氢键,以及溶剂极性对氢键的影响。
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

楼主是想考察分子处于激发态时是如何形成分子内氢键的,和溶剂效应对这个氢键的影响?
激发态的工作没有做过,只做过基态的,只能说个大概的思路。
思路:分子处于激发态时,进行几何优化,对优化完毕的构型进行分析,看看是N还是O与羟基的H形成氢键,可以从距离直观判断,从能量大小来判断哪个更容易。对优化构型加上个溶剂模型,可以选择PCM,CPCM模型等,哪个模型合适要进行尝试,或者依据文献,或者跟实验值比较来确定。优化完毕后,同上分析。
最后结合NBO和AIM理论来对构型进行分析,说明是某某跟H形成氢键。
操作:在高斯软件中如何进行激发态计算,几何优化等操作,自己要去看高斯手册,遇到问题找小木虫。
既然有氢键,要考虑到弱相互作用,B3LYP显然不太合适。选择合适的方法和基组来计算,这个要自己尝试,或者依据文献。
3楼2014-03-14 21:31:33
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
diligence89: 金币+5, 有帮助, 新手,您能把计算过程叙述一遍吗,从分子基态优化开始,到最后得出结果,每一步用什么方法合适。我还有300个金币,如果您能帮我解决这个问题的话,都可以给您的 2014-03-14 19:16:06
要考虑极性的话 可以加入溶剂化模型
2楼2014-03-14 14:18:51
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