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feiyun2006

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by tangbao66 at 2014-03-13 00:22:59
楼主用什么方法转化的!模式菌还是野生菌啊!

我们做的是野生菌吧,具体来源我也不清楚
心静自然凉
11楼2014-03-17 15:43:37
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feiyun2006

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-03-12 20:54:56
求关于线性质粒重组效率更高的参文,诚谢啊...

(1) 从我看的文献来看,环状质粒由于结构的原因多用于单交换;而双交换进行的同源重组则一般采用线状片段。Mol Biol Rep (2010) 37:2207–2213
(2) 效率是不是更高还真不知道,希望多指点指点
心静自然凉
12楼2014-03-18 22:44:08
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by feiyun2006 at 2014-03-18 22:44:08
(1) 从我看的文献来看,环状质粒由于结构的原因多用于单交换;而双交换进行的同源重组则一般采用线状片段。Mol Biol Rep (2010) 37:2207–2213
(2) 效率是不是更高还真不知道,希望多指点指点...

如果目的片段具左右同源臂,以环状质粒转进目标菌后,是不是先发生单交换,质粒整合到基因组上;然后再发生二次重组,质粒片段丢弃?如果线性质粒的话,是直接进行相当于前述的二次重组?不太懂,求指教。

另:接合转移的话,转入的是线性质粒吗?
做一个阳光、开朗的小和尚
13楼2014-03-19 09:15:47
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feiyun2006

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-03-19 09:15:47
如果目的片段具左右同源臂,以环状质粒转进目标菌后,是不是先发生单交换,质粒整合到基因组上;然后再发生二次重组,质粒片段丢弃?如果线性质粒的话,是直接进行相当于前述的二次重组?不太懂,求指教。

另: ...

我比较赞同你的观点,线状片段只有发生了双交换的才能进行抗性筛选。你们实验室是怎么做芽孢杆菌基因敲除的啊?
  接合转移我没做过。
  
心静自然凉
14楼2014-03-19 14:21:14
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by feiyun2006 at 2014-03-19 14:21:14
我比较赞同你的观点,线状片段只有发生了双交换的才能进行抗性筛选。你们实验室是怎么做芽孢杆菌基因敲除的啊?
  接合转移我没做过。
  ...

我们正打算做,前面做的假单胞菌的。因为直接把目的基因敲除,而不是用标记片段替换;所以采用接合转移,用自杀载体上的标记基因筛选第一次重组;之后SacB筛选二次重组的。
我想了一下,我们前面做的不适合采用线性质粒(因为直接双交换,又没有筛选标记)。

马上要做芽孢杆菌的了,求交流学习。。^_^
做一个阳光、开朗的小和尚
15楼2014-03-19 18:41:13
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)

用的是RED重组质粒吗?同源臂有多长?是否在基因组有相同序列?
16楼2014-03-19 20:29:31
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