应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » amber最大可以输出多少个frame
51/1返回列表
查看: 1003  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

ningll10

新虫 (小有名气)

[求助] amber最大可以输出多少个frame

最近用AMBER做REMD，发现只能做200ns，当轨迹数超过100million的时候，轨迹数输出为*******的格式，无法把超过200ns的轨迹提取出来。我用的是amber10，不知道amber11, amber12中有没有对frame数的限制。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2014-03-08 17:00:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ningll10

新虫 (小有名气)
即使一次算那个短，很多次加起来还是很长。因为我是做REMD，收敛需要比较长的时间。
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-08 17:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

aa7899379

金虫 (小有名气)
上限是多少没试过，但是不建议楼主一次性计算太长时间，容易出现错误。最好分成几次，一次5到10ns。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-08 17:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hcf春妮

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ningll10 at 2014-03-08 17:31:48
即使一次算那个短，很多次加起来还是很长。因为我是做REMD，收敛需要比较长的时间。

您好 ，我现在在用Gromacs做REMD，我看了官网，给出的信息基本上都是理论知识，具体的做法不太清楚，请问您对于这个清楚吗？
赞一下 回复此楼
4楼2017-04-25 15:26:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsbaa1937

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
5楼2017-05-01 07:02:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭