24小时热门版块排行榜    

查看: 1301  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 诡异的dmol3?! 已有9人参与

背景:不论是我的pc还是我的服务器 都关闭了超线程了
pc的cpu是i3的,双核;服务器的cpu是当年E5的32nm的早期型号,两颗,每颗6核,共12核
pc是win7,服务器是centos6

是这样 一个dmol3任务 400+个原子 全都是C/H/N 无对称 无周期 方法b3lyp,加grimme的disp校正,基组dnd3.5

我放在pc上跑 只见两颗i3的核心全部飙到100% 我满意地走了 一夜又一上午过去了 结果一共跑了10个step

我怒了 这也太慢了 强制结束 扔进服务器里 只见12颗e5的核心全部飙到100% 我满意地关了xshell 跑了一下午又一晚上,早上一开 一共跑了12个step

我瞠目结舌了 这服务器还有没有节操?

[ Last edited by yjcmwgk on 2014-3-5 at 09:34 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyzzz986

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
少用几个核心看看,dmol的并行不是一般的垃圾
11楼2014-03-08 12:40:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

lgxyz

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用的7.0?b3lyp可能就是慢,用纯泛函试试PBE,应该不会这么慢。
2楼2014-03-05 11:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
假设CPU速度一样,12核和双核 也应该是能拉开差距的啊

内存不够会报错,我推测可能硬盘读写速度成了瓶颈

难道是装不下,虚拟内存,或者SWAP 区 反复在磁盘里倒腾这样的感觉

另外PC跑400个原子得多大内存啊。。。
3楼2014-03-05 16:33:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by qzhost at 2014-03-05 16:33:25
假设CPU速度一样,12核和双核 也应该是能拉开差距的啊

内存不够会报错,我推测可能硬盘读写速度成了瓶颈

难道是装不下,虚拟内存,或者SWAP 区 反复在磁盘里倒腾这样的感觉

另外PC跑400个原子得多大内存啊 ...

其实没用多大内存啦
我的pc有4G内存 win7只给我认出来3G多 有几百兆被win7吃了
然后 平时不跑任务 系统占用七八百兆
跑这个任务的时候 内存也才占到了2.4G-2.6G的样子
其实吧 现在的PC 不配4G不幸福
4楼2014-03-05 17:08:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +10 Zhao anqi 2026-03-22 10/500 2026-03-24 00:08 by Equinoxhua
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +6  ̄^ ̄゜汗 2026-03-19 9/450 2026-03-23 19:53 by pswait
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 +4 石能伟 2026-03-17 4/200 2026-03-23 17:51 by 17862566385
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +8 tcxiaoxx 2026-03-20 9/450 2026-03-23 12:16 by tcxiaoxx
[考研] 317求调剂 +12 申子申申 2026-03-19 18/900 2026-03-22 22:23 by luoyongfeng
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 0854电子信息求调剂 +3 α____ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:28 by zhq0425
[考研] 一志愿中南化学(0703)总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂,总分315(英一) +5 sbdksD 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见