24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 772  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 妹子是autodock的新手,向高手请教。已有1人参与

接触AUTODOCK不久,自己学的晕头脑。有两个问题想前辈们请教,还望前辈们不吝赐教。
1:蛋白残基若有不全,是否一定要补全,有可能是在口袋附件的,我看我有些同学之间对接也不补全。
2:
Ligand>Torsion Tree>Detect Root…
Ligand>Torsion Tree>Show Root Expansion
Ligand>Torsion Tree>Show/Hind Root Marker
Ligand>Torsion Tree>Choose Torsions…>Done
Ligand>Input>Choose…>
不大明白这部是什么含义,然后怎么选择Torsion Count对话框里的选项。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junjun0711

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2014-03-04 21:36:13
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的

那定义那个根原子是个什么含义
3楼2014-03-05 09:07:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
junjun0711: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-03-05 09:06:59
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-05 18:13:59
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的
2楼2014-03-04 21:36:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见