24小时热门版块排行榜    

查看: 984  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 妹子是autodock的新手,向高手请教。 已有1人参与

接触AUTODOCK不久,自己学的晕头脑。有两个问题想前辈们请教,还望前辈们不吝赐教。
1:蛋白残基若有不全,是否一定要补全,有可能是在口袋附件的,我看我有些同学之间对接也不补全。
2:
Ligand>Torsion Tree>Detect Root…
Ligand>Torsion Tree>Show Root Expansion
Ligand>Torsion Tree>Show/Hind Root Marker
Ligand>Torsion Tree>Choose Torsions…>Done
Ligand>Input>Choose…>
不大明白这部是什么含义,然后怎么选择Torsion Count对话框里的选项。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junjun0711

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2014-03-04 21:36:13
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的

那定义那个根原子是个什么含义
3楼2014-03-05 09:07:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
junjun0711: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-03-05 09:06:59
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-05 18:13:59
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的
2楼2014-03-04 21:36:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +5 布布和一二 2026-08-10 6/300 2026-08-10 18:03 by Tide man
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] filecode +6 documentary 2026-08-10 6/300 2026-08-10 17:09 by wdc28
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 11/550 2026-08-10 17:09 by 六两废铜
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +14 Lanmanbaby 2026-08-09 22/1100 2026-08-10 14:57 by wwncly
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
请填处理意见