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junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 妹子是autodock的新手,向高手请教。 已有1人参与

接触AUTODOCK不久,自己学的晕头脑。有两个问题想前辈们请教,还望前辈们不吝赐教。
1:蛋白残基若有不全,是否一定要补全,有可能是在口袋附件的,我看我有些同学之间对接也不补全。
2:
Ligand>Torsion Tree>Detect Root…
Ligand>Torsion Tree>Show Root Expansion
Ligand>Torsion Tree>Show/Hind Root Marker
Ligand>Torsion Tree>Choose Torsions…>Done
Ligand>Input>Choose…>
不大明白这部是什么含义,然后怎么选择Torsion Count对话框里的选项。
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pymol

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
junjun0711: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-03-05 09:06:59
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-05 18:13:59
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的
2楼2014-03-04 21:36:13
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junjun0711

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2014-03-04 21:36:13
1:Autodock 对于大部分有晶体结构的蛋白,可以不用补全残基....
2:这是修改配体柔性基团的

那定义那个根原子是个什么含义
3楼2014-03-05 09:07:53
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