| 查看: 851 | 回复: 8 | |||
vikkihe金虫 (初入文坛)
|
[求助]
计算求助 已有2人参与
|
| 计算遇到的问题。算死了，但是没有提示算死的错误代码及原因。只是算到偶极矩那里就死了。急求好心人帮忙！！现把GIF和out文件上传 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 111.out
2014-02-26 17:50:33, 63.3 K
» 猜你喜欢
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有82人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有1人回复
-
实际气体内压强的微观机制或将改写--------从一个基本的力学佯谬说起
已经有2人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有5人回复
-
招收0703开头的学硕调剂生 线上复试
已经有5人回复
-
求助：三乙酰丙酮铁（Fe(acac)₃）标准红外(IR)与XRD谱图/数据
已经有1人回复
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-02-26 22:40:54
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 09:20:48
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-02-26 22:40:54
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 09:20:48
|
看了一下分子，20C-31C，相距只有1.17，被GV判为三键。显然是错误了。如果将它设为单键，点击面版上的“小刷”初步优化一下，这个单键调整为1.54。 另外这两个分子之间是什么作用？从原子看应为氢键，但从现在的距离看是范德华作用。既是分子间作用，你用的方法和基组是否合用？ |
2楼2014-02-26 20:39:22
许洛
木虫 (著名写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1864.8
- 红花: 1
- 沙发: 1
- 帖子: 1044
- 在线: 124.3小时
- 虫号: 2560297
- 注册: 2013-07-23
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
3楼2014-02-26 20:58:16
vikkihe
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 676.3
- 帖子: 49
- 在线: 33.3小时
- 虫号: 1421561
- 注册: 2011-09-28
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2014-02-26 21:24:07
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
5楼2014-02-26 21:48:57
vikkihe
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 676.3
- 帖子: 49
- 在线: 33.3小时
- 虫号: 1421561
- 注册: 2011-09-28
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
6楼2014-02-27 09:25:32
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+4 2014-02-27 17:25:06
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 18:47:22
gkf高: 金币+4 2014-02-27 17:25:06
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 18:47:22
|
与其分析你的分子，不如干脆将你的输入算一下，因为是opt，还在算。 在计算还在进行的时候，程序会不断续写out文件，将out文件点击用GV打开，就可看见优化的阶段情况，现在是二者正在拉开... 你现在的问题是如何确定二者形成氢键的具体组合形式。 目前的组合形式形式似乎不能形成氢键，一个O、F同时均等地与两个H起作用，倒像是分子间的超共轭。当然还在算。 如果是氢键，是左边分子的孤对电子指向右边缺电子较多的H，现在-CH3上的H显然不是。而且给出的初始结构对于分子平面完全对称，优化并不能将这个分子平面折叠成角度，优化也不能自己找到可能的氢键格局，目前这个结构正在拉开。 你可能要选择另外的组合结构。 |
7楼2014-02-27 16:53:40
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
8楼2014-02-27 20:27:08
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
vikkihe: 金币+40, ★★★很有帮助 2014-03-07 11:41:24
vikkihe: 金币+40, ★★★很有帮助 2014-03-07 11:41:24
|
计算还在继续。 因为将分子拉开距离很长，每一个步长要从头计算一遍，当初没有想到，放在正工作的机子上顺便算一下，很慢。 现在距离已经超过了氢键了，即不会形成氢键。进入了范德华作用距离，现在O---H的最近距离是3.0，F---H最近距离是2.8。右边的分子开始微有旋转，以调整二者相互作用的位置。范德华作用的可能性是有的。 为此： 1、需要重新考虑二者的组合、组装，以便考察是否会形成氢键； 2、或者将二者重叠起来，考察分子间π-π相互作用。 |
9楼2014-02-28 11:30:22
30