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vikkihe

金虫 (初入文坛)

[求助] 计算求助 已有2人参与

计算遇到的问题。算死了,但是没有提示算死的错误代码及原因。只是算到偶极矩那里就死了。急求好心人帮忙!!现把GIF和out文件上传
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  • 2014-02-26 17:50:33, 63.3 K

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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
vikkihe: 金币+40, ★★★很有帮助 2014-03-07 11:41:24
计算还在继续。
因为将分子拉开距离很长,每一个步长要从头计算一遍,当初没有想到,放在正工作的机子上顺便算一下,很慢。

现在距离已经超过了氢键了,即不会形成氢键。进入了范德华作用距离,现在O---H的最近距离是3.0,F---H最近距离是2.8。右边的分子开始微有旋转,以调整二者相互作用的位置。范德华作用的可能性是有的。

为此:
1、需要重新考虑二者的组合、组装,以便考察是否会形成氢键;
2、或者将二者重叠起来,考察分子间π-π相互作用。
9楼2014-02-28 11:30:22
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查看全部 9 个回答

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-02-26 22:40:54
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 09:20:48
看了一下分子,20C-31C,相距只有1.17,被GV判为三键。显然是错误了。如果将它设为单键,点击面版上的“小刷”初步优化一下,这个单键调整为1.54。
另外这两个分子之间是什么作用?从原子看应为氢键,但从现在的距离看是范德华作用。既是分子间作用,你用的方法和基组是否合用?
2楼2014-02-26 20:39:22
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许洛

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
高手啊 我也想学习计算 能交流一下呗
3楼2014-02-26 20:58:16
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vikkihe

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-02-26 20:39:22
看了一下分子,20C-31C,相距只有1.17,被GV判为三键。显然是错误了。如果将它设为单键,点击面版上的“小刷”初步优化一下,这个单键调整为1.54。
另外这两个分子之间是什么作用?从原子看应为氢键,但从现在的距 ...

很感谢,是这个问题。之前没有注意到。这个是氢键,另外我想问问这种弱氢键用B97D的方法是否可行?谢谢
4楼2014-02-26 21:24:07
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