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vikkihe

金虫 (初入文坛)

[求助] 计算求助 已有2人参与

计算遇到的问题。算死了，但是没有提示算死的错误代码及原因。只是算到偶极矩那里就死了。急求好心人帮忙！！现把GIF和out文件上传
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  • 附件 1 : 111.out
    • 2014-02-26 17:50:33, 63.3 K

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1楼 2014-02-26 17:54:19
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+4 2014-02-27 17:25:06
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 18:47:22
与其分析你的分子，不如干脆将你的输入算一下，因为是opt，还在算。

在计算还在进行的时候，程序会不断续写out文件，将out文件点击用GV打开，就可看见优化的阶段情况，现在是二者正在拉开...

你现在的问题是如何确定二者形成氢键的具体组合形式。
目前的组合形式形式似乎不能形成氢键，一个O、F同时均等地与两个H起作用，倒像是分子间的超共轭。当然还在算。

如果是氢键，是左边分子的孤对电子指向右边缺电子较多的H，现在-CH3上的H显然不是。而且给出的初始结构对于分子平面完全对称，优化并不能将这个分子平面折叠成角度，优化也不能自己找到可能的氢键格局，目前这个结构正在拉开。

你可能要选择另外的组合结构。
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7楼2014-02-27 16:53:40
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-02-26 22:40:54
vikkihe: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-02-27 09:20:48
看了一下分子，20C-31C，相距只有1.17，被GV判为三键。显然是错误了。如果将它设为单键，点击面版上的“小刷”初步优化一下，这个单键调整为1.54。
另外这两个分子之间是什么作用？从原子看应为氢键，但从现在的距离看是范德华作用。既是分子间作用，你用的方法和基组是否合用？
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2楼2014-02-26 20:39:22
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许洛

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
高手啊 我也想学习计算 能交流一下呗
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3楼2014-02-26 20:58:16
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vikkihe

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-02-26 20:39:22
看了一下分子，20C-31C，相距只有1.17，被GV判为三键。显然是错误了。如果将它设为单键，点击面版上的“小刷”初步优化一下，这个单键调整为1.54。
另外这两个分子之间是什么作用？从原子看应为氢键，但从现在的距 ...

很感谢，是这个问题。之前没有注意到。这个是氢键，另外我想问问这种弱氢键用B97D的方法是否可行？谢谢
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4楼2014-02-26 21:24:07
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