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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 散重金求助，perl语言问题
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桃子三三

银虫 (小有名气)

[求助] 散重金求助，perl语言问题 已有1人参与

两个文本求合集的程序
文件1.txt,内容如下
>Os01g0100100        1213       
>Os01g0100200        1257       
>Os01g0100500        524        701        1293        1384        1427       
>Os01g0100600        799        961        1068        1795       
>Os01g0100700        379        498       
>Os01g0100800        1409        1670       
>Os01g0100900        166        432        1054       
>Os01g0101200        0       
>Os01g0101600        209        258        371        1115        1494        1528       
>Os01g0101700        60        399        429        462        828        889       
文件2.txt，内容如下
>Os01g0100100        0       
>Os01g0100200        0       
>Os01g0100500        0       
>Os01g0100600        0       
>Os01g0100700        0       
>Os01g0100800        0       
>Os01g0100900        0       
>Os01g0101200        123       
>Os01g0101600        0       
>Os01g0101700        0       
想看合集后的情况，并生成一个文本。
重金求谢！！！！
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1楼 2014-02-18 18:09:42
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
perl语言是生物信息学领域的实用编程语言，建议到生物信息版块找高手看，我是不懂这个玩意。
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5楼2014-02-19 19:26:34
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XOooZzz

银虫 (小有名气)
不懂perl，且也没看懂你说的求合集是什么意思。
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2楼2014-02-18 20:29:19
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桃子三三

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XOooZzz at 2014-02-18 20:29:19
不懂perl，且也没看懂你说的求合集是什么意思。

就是比如〉Os01g0101700  0（文本1）
            〉Os01g0101700  12（文本2）
生产（文本3） 〉Os01g0101700  12
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3楼2014-02-18 20:35:41
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XOooZzz

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
桃子三三(kx444555代发): 金币+10, 鼓励交流 2014-02-20 08:29:11
perl没学过，不懂语法。不过除非perl有现成的实现你的功能的函数，否则算法应该和其它语言的差不多。主程序框架大概是这样吧：

1、读取文件1的一行数据;
2、提取该行数据的基因号;
3、找到文件2中含该基因号的行并记下该行行号;
4、合并这行的数值;
5、将生成的新行写入新文件;
返回步骤1处理下一行的数据，直到已经把文件1处理完;
6、如果文件2有些行没与文件1对上，把这些行也复制到新文件中;
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2014-02-19 11:07:52
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